RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 MTMR10Q9NXD2 777 aa23.45■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 CHADLQ6NUI6 762 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 ZFAND2BQ8WV99 257 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC120Q96HB5 630 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 DGAT2Q96PD7 388 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 ST14Q9Y5Y6 855 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 M0R2N6 131 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 VIPR1P32241 457 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 ARSFP54793 590 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 GSCP56915 257 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF101Q8IZC7 436 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF350Q9GZX5 532 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 STC1P52823 247 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 ARF1P84077 181 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 DHRS1Q96LJ7 313 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 SMIM30A4D0T7 59 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 LCHNA4D1U4 455 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 SLITRK5O94991 958 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 C6orf47O95873 294 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 BMP8BP34820 402 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 ENTPD1P49961 510 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 ENAMQ9NRM1 1142 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC35F4A4IF30 521 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF726A6NNF4 738 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP6AP1Q15904 470 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 CHRDL2Q6WN34 429 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 FOXRED2Q8IWF2 684 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 PQLC3Q8N755 202 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 TSSK6Q9BXA6 273 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 MS4A12Q9NXJ0 267 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 RHCGQ9UBD6 479 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 M0R036 132 aa23.43■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 TYROBPO43914 113 aa23.43■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 TAS2R50P59544 299 aa23.43■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 RAB39AQ14964 217 aa23.43■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 JAGN1Q8N5M9 183 aa23.43■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa23.43■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 SMOC2Q9H3U7 446 aa23.43■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF121Q9H920 327 aa23.43■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 NEUROD4Q9HD90 331 aa23.43■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD66B4E2M5 251 aa23.43■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDHGA12O60330 932 aa23.43■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 NRG3P56975 720 aa23.43■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 DSG2Q14126 1118 aa23.43■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 CD244Q9BZW8 370 aa23.43■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 TBCCD1Q9NVR7 557 aa23.43■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 GABBR2O75899 941 aa23.43■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 TMBIM6P55061 237 aa23.43■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 RPS13P62277 151 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 PHC2Q8IXK0 858 aa23.43■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 LNX2Q8N448 690 aa23.43■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 OR51I1Q9H343 314 aa23.43■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 ERVK-11Q9UQG0 969 aa23.43■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC6A9P48067 706 aa23.43■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 BTBD16Q32M84 506 aa23.43■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM76BQ5HYJ3 339 aa23.43■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 SIGLEC10Q96LC7 697 aa23.43■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa23.43■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa23.43■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 STATHP02808 62 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC39A4Q6P5W5 647 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 C7orf57Q8NEG2 295 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 CD180Q99467 661 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 RDH8Q9NYR8 311 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 HSPB11Q9Y547 144 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 APOL3O95236 402 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 EPCAMP16422 314 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 RPP38P78345 283 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 PON3Q15166 354 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 ZMYND11Q15326 602 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 TPGS2Q68CL5 300 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 TMED4Q7Z7H5 227 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 RELL1Q8IUW5 271 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 OR2L2Q8NH16 312 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 IL12RB2Q99665 862 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 SLIT2O94813 1529 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 MYOM1P52179 1685 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 MATN1P21941 496 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 LCN1P31025 176 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 ACTR1BP42025 376 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 ACTR1AP61163 376 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP1R3AQ16821 1122 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF130Q86XS8 419 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 OR56A1Q8NGH5 318 aa23.42■■□□□ 1.34
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.6 ms