RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 PAQR3Q6TCH7 311 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 GOLM1Q8NBJ4 401 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 OR13C4Q8NGS5 318 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 NFKBIDQ8NI38 313 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 TMEM234Q8WY98 164 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 KCNJ9Q92806 393 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SIPA1Q96FS4 1042 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 LRCH3Q96II8 777 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 MAGIXQ9H6Y5 334 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ZBTB26Q9HCK0 441 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ENY2Q9NPA8 101 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 TMEM45AQ9NWC5 275 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SPEF1Q9Y4P9 236 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ZNF536O15090 1300 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 A0A1W2PP18 115 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 FAM149AA5PLN7 773 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 HTR3EA5X5Y0 456 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 FAM221BA6H8Z2 402 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 H0YAE9 185 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 NOBOXO60393 691 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 TMEM63AO94886 807 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 BCHEP06276 602 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 NPR2P20594 1047 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 CAPZA1P52907 286 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 RING1Q06587 406 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ZNF33BQ06732 778 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 IRF5Q13568 498 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 TPRG1LQ5T0D9 272 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 NCEH1Q6PIU2 408 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ISLR2Q6UXK2 745 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SATL1Q86VE3 508 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SPERTQ8NA61 448 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 OR5P2Q8WZ92 322 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 CITED4Q96RK1 184 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ZNF382Q96SR6 550 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 CD180Q99467 661 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 CCSER2Q9H7U1 834 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 TRPV4Q9HBA0 871 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SNTG1Q9NSN8 517 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 KLRF1Q9NZS2 232 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 TAC3Q9UHF0 121 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 CDH10Q9Y6N8 788 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 A0A096LPI6 279 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 A0A1B0GVI7 797 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 DNM1LO00429 736 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 GMFGO60234 142 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 AHSA1O95433 338 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 PRH1P02810 166 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 MT-ND5P03915 603 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 NELFEP18615 380 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 DSC3Q14574 896 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 CILP2Q8IUL8 1156 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 OR8H1Q8NGG4 311 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 GRHL3Q8TE85 626 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ZDHHC12Q96GR4 267 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 CMKLR1Q99788 373 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 VRTNQ9H8Y1 702 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 A0A1W2PRU2 124 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 IQCF5A8MTL0 148 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ANKRD66B4E2M5 251 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 LEFTY2O00292 366 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SLC31A1O15431 190 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 TSPAN6O43657 245 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SYNGR4O95473 234 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 KLK1P06870 262 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ANXA3P12429 323 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ETS2P15036 469 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 RPL10P27635 214 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 PDHA2P29803 388 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ZNF763Q0D2J5 394 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 GANABQ14697 944 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 HACD2Q6Y1H2 254 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 MARCH9Q86YJ5 346 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 PARP8Q8N3A8 854 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ZNF565Q8N9K5 539 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 CLEC4CQ8WTT0 213 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ZNF516Q92618 1163 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 TMBIM1Q969X1 311 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 BMFQ96LC9 184 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ZNF285Q96NJ3 590 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 KCNH6Q9H252 994 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 MINDY3Q9H8M7 445 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SRRDQ9UH36 339 aa7□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 KCPQ6ZWJ8 1503 aa7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms