RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 SMU1Q2TAY7 513 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF852Q6ZMS4 543 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 DEFB128Q7Z7B8 93 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 RAB43Q86YS6 212 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 SLC30A2Q9BRI3 323 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 FBXL12Q9NXK8 326 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 UNC80Q8N2C7 3258 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 PCDH17O14917 1159 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 CLEC2LP0C7M8 214 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 CXCR2P25025 360 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 RGS6P49758 472 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 RPS26P62854 115 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 ACVR1Q04771 509 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 RUNX1T1Q06455 604 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 XKR6Q5GH73 641 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 LIPKQ5VXJ0 399 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 CD300LGQ6UXG3 332 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 ASPNQ9BXN1 380 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 KCNH6Q9H252 994 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 KCNK5O95279 499 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 SLC11A2P49281 568 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 PROX2Q3B8N5 592 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 PYDC2Q56P42 97 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 ATG9BQ674R7 924 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 NOXRED1Q6NXP6 359 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 MTERF3Q96E29 417 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 DIRAS2Q96HU8 199 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 TRIB3Q96RU7 358 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 RPS6KA6Q9UK32 745 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa16.17■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 TBKBP1A7MCY6 615 aa16.17■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 TNNI3P19429 210 aa16.17■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 IL18R1Q13478 541 aa16.17■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 SPDYE7PQ495Y7 208 aa16.17■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 SMUG1Q53HV7 270 aa16.17■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 GALNT13Q8IUC8 556 aa16.17■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 COQ7Q99807 217 aa16.17■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 TMEM39AQ9NV64 488 aa16.17■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 SCML2Q9UQR0 700 aa16.17■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 C5orf42Q9H799 3197 aa16.17■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 A0A1B0GVC2 190 aa16.17■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 A0A1W2PQ09 198 aa16.17■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 MGAT4DA6NG13 374 aa16.17■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 A6NIN4 97 aa16.17■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 SAGE2PA6NJ88 616 aa16.17■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 YY2O15391 372 aa16.17■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 ACSL4O60488 711 aa16.17■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 TBL1XO60907 577 aa16.17■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 C9P02748 559 aa16.17■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF181Q2M3W8 571 aa16.17■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 C17orf99Q6UX52 265 aa16.17■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa16.17■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 IL17RDQ8NFM7 739 aa16.17■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 COQ8BQ96D53 544 aa16.17■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 YME1L1Q96TA2 773 aa16.17■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa16.17■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 PTGER1P34995 402 aa16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP16.16■□□□□ 0.188e-6■■■□□ 17.7
CTDP1-201ENST00000075430 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 CLLU1OSQ5K130 101 aa16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 DBF4BQ8NFT6 615 aa16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 DHRS1Q96LJ7 313 aa16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 CCDC115Q96NT0 180 aa16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 COMMD3Q9UBI1 195 aa16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 SEPT4O43236 478 aa16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 CCNYL3P0C7X3 344 aa16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 TYMPP19971 482 aa16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 HOXC5Q00444 222 aa16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 CACNG1Q06432 222 aa16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 CDH18Q13634 790 aa16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 PDZK1Q5T2W1 519 aa16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 ARTNQ5T4W7 220 aa16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 SDE2Q6IQ49 451 aa16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 OLIG3Q7RTU3 272 aa16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 BBS7Q8IWZ6 715 aa16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF683Q8IZ20 524 aa16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 GHDCQ8N2G8 530 aa16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 SP140LQ9H930 580 aa16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 IL26Q9NPH9 171 aa16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 OTOFQ9HC10 1997 aa16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 CACNA1CQ13936 2221 aa16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 CLCA1A8K7I4 914 aa16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 FAM220BPB1ANY3 271 aa16.16■□□□□ 0.18
CTDP1-201ENST00000075430 EPOP01588 193 aa16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms