RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 BtdQ8CIF4 520 aa9.88□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Agr3Q8R3W7 165 aa9.88□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mri1Q9CQT1 369 aa9.88□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q9D3J9 298 aa9.88□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Apbb2Q9DBR4 760 aa9.88□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Szt2A2A9C3 3431 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fbxo47A2A6H3 451 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1006A2ALD2 312 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm7714E9Q079 131 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Herc6F2Z461 1003 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Npc1O35604 1277 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Igfbp2P47877 305 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zmat1Q3V0C1 714 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm11492Q5ND19 536 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nqo1Q64669 274 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam181bQ80VF6 417 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rbm11Q80YT9 238 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 B130006D01RikQ8BRH6 153 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hs3st5Q8BSL4 346 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Acat2Q8CAY6 397 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Map3k21Q8VDG6 1002 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Impa2Q91UZ5 290 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cts7Q91ZF2 331 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 TMEM121BQ99MX7 572 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lyrm1Q9CQB7 122 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gkn2Q9CQS6 184 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm16286Q9CQX6 220 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q9D1F3 157 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Creb3l4Q9D2A5 370 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fbxl12Q9EPX5 326 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Psma4Q9R1P0 261 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fem1aaQ9Z2G1 654 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm4869A0A1B0GSG7 984 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nlrp1bA1Z198 1177 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Phf11A6H5X4 337 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gabrr3B2RXA8 464 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm6569D3YTM9 175 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tssk2O54863 358 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 F2rl3O88634 396 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc6a11P31650 627 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kcnj2P35561 428 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 ThrbP37242 461 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tsc22d1P62500 1077 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Anxa4P97429 319 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tstd2Q3U269 495 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm5460Q3UQ97 254 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cldn34b4Q3V0X2 211 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mrm3Q5ND52 418 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krba1Q6NXZ1 1043 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PianpQ6P1B3 278 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nudcd1Q6PIP5 582 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Atp6v1g3Q8BMC1 118 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Map4k5Q8BPM2 847 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 GmppbQ8BTZ7 360 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Prmt5Q8CIG8 637 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn1r234Q8R298 329 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn1r38Q8R2E1 302 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ppp1r8Q8R3G1 351 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ifi44lQ9BDB7 447 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cmtm6Q9CZ69 183 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hhipl2Q9D2G9 717 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc5a3Q9JKZ2 718 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmeff2Q9QYM9 374 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mapk9Q9WTU6 423 aa9.87□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1188A2AV10 312 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm29394H3BIW7 199 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm10324L7N208 604 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn1r31L7N2F1 303 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gpx5P21765 221 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nrg2P56974 756 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Polr2iP60898 125 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tbpl1P62340 186 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 BmxP97504 651 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ap5b1Q3TAP4 876 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm14226Q3TZL0 686 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam129aQ3UW53 926 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zc3h12aQ5D1E7 596 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pik3r3Q64143 461 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 DgkbQ6NS52 802 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fbxl19Q6PB97 674 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Chst2Q80WV3 530 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fbxl4Q8BH70 621 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc43a1Q8BSM7 564 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 B3gnt7Q8K0J2 397 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Adgrg1Q8K209 687 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 FbrsQ8R089 466 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Utp4Q8R2N2 686 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nxnl1Q8VC33 217 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nprl3Q8VIJ8 569 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Chil4Q91Z98 402 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ppp2r2dQ925E7 453 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 EtfaQ99LC5 333 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Senp8Q9D2Z4 221 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hipk3Q9ERH7 1192 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Znf318Q99PP2 2237 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Crybg1A0A0G2JG52 2065 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Igkv6-29A0A0G2JEI6 115 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam209A2APA5 170 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 1700011I03RikE9PYL8 271 aa9.86□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Spata31d1cE9QAF1 853 aa9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.9 ms