RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613795.4

CLCN3-211, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN3, Length 5,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-211ENST00000613795 ANKRD53Q8N9V6 530 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CD300LFQ8TDQ1 290 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 NR4A3Q92570 626 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 NTAN1Q96AB6 310 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 APOLD1Q96LR9 279 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 BTBD1Q9H0C5 482 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 MAGIXQ9H6Y5 334 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 EXO5Q9H790 373 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 BRD7Q9NPI1 651 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TAS2R10Q9NYW0 307 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 A0A1W2PQH9 124 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GLTPD2A6NH11 291 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 YDJCA8MPS7 323 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 UNGP13051 313 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ABHD18Q0P651 414 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 FGFBP1Q14512 234 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SEC23BQ15437 767 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 UGT8Q16880 541 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 COQ5Q5HYK3 327 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ATAD3CQ5T2N8 411 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 LCN8Q6JVE9 175 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 OR5B17Q8NGF7 314 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 AMBNQ9NP70 447 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa6.69□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 AKAP12Q02952 1782 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 WNT7AO00755 349 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 VILLO15195 856 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CREG1O75629 220 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 KRT33AO76009 404 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SNAPINO95295 136 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 IFNA21P01568 189 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PDHA2P29803 388 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 NUDT1P36639 197 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PIK3CBP42338 1070 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SMSP52788 366 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF33AQ06730 810 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CEACAM7Q14002 265 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CDK10Q15131 360 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 FTMTQ8N4E7 242 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 BEST4Q8NFU0 473 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 OR8J3Q8NGG0 315 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 FATE1Q969F0 183 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 RNF31Q96EP0 1072 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 NT5DC2Q9H857 520 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 COQ3Q9NZJ6 369 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PRKAB1Q9Y478 270 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SNX10Q9Y5X0 201 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 MEIOCA2RUB1 952 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 LRRC72A6NJI9 287 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SLC7A4O43246 635 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PRAF2O60831 178 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ESR1P03372 595 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 HLA-EP13747 358 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CD247P20963 164 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 NDUFS1P28331 727 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PTGER3P43115 390 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PRKAG1P54619 331 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 DSTNP60981 165 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PRKCDQ05655 676 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 DSG2Q14126 1118 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 EIPR1Q53HC9 387 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 FRRS1Q6ZNA5 592 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 MINDY1Q8N5J2 469 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TERB2Q8NHR7 220 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ARL11Q969Q4 196 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SGK2Q9HBY8 427 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 DEC1Q9P2X7 70 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 FZD10Q9ULW2 581 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CDH10Q9Y6N8 788 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TMEM150BA6NC51 233 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 C9JVG2 144 aa6.68□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SEPT4O43236 478 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms