RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589318.5

DDX39A-209, Transcript of DExD-box helicase 39A, human

TSL 1 (best)

Gene DDX39A, Length 1,903 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX39A-209	ENST00000589318	BMX	P51813	675 aa		14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	KIAA1024L	P59773	190 aa		14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	RHD	Q02161	417 aa		14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	OXA1L	Q15070	435 aa		14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	SGO1	Q5FBB7	561 aa		14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	LIPJ	Q5W064	366 aa		14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	REP15	Q6BDI9	236 aa		14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	TAMM41	Q96BW9	452 aa		14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	MENT	Q9BUN1	341 aa		14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318		C9JVG2	144 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	RGS14	O43566	566 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	SEMA4F	O95754	770 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	ERG	P11308	486 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	CAPN3	P20807	821 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	DPP6	P42658	865 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	CLCNKA	P51800	687 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	IRF8	Q02556	426 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	PRKCQ	Q04759	706 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	STX5	Q13190	355 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	TUBA3C	Q13748	450 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	CEACAM7	Q14002	265 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	LRP8	Q14114	963 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	DOC2A	Q14183	400 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	RETREG3	Q86VR2	466 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	NEIL2	Q969S2	332 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	IL17F	Q96PD4	163 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	NRTN	Q99748	197 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	ACTL8	Q9H568	366 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	SNX6	Q9UNH7	406 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	KCNK6	Q9Y257	313 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	PRSS38	A1L453	326 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	SERTM1	A2A2V5	107 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	FPGT	O14772	594 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	ANKRD28	O15084	1053 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	BMP2	P12643	396 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	NPPB	P16860	134 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	CCNA2	P20248	432 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	IL12A	P29459	219 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	CASP2	P42575	452 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	CCT8	P50990	548 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	PNLIPRP1	P54315	467 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	UFM1	P61960	85 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	MS4A2	Q01362	244 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF846	Q147U1	533 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	NFATC4	Q14934	902 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	KIAA0040	Q15053	153 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	NRF1	Q16656	503 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	SMU1	Q2TAY7	513 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	XKR6	Q5GH73	641 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	FRG2	Q64ET8	278 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	FRG2B	Q96QU4	278 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	COL6A3	P12111	3177 aa		14.84	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		14.83	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	NRP2	O60462	931 aa		14.83	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	IGHV4-34	P06331	123 aa		14.83	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		14.83	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	G6PD	P11413	515 aa		14.83	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	KEL	P23276	732 aa		14.83	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	14.83	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	RCAN2	Q14206	197 aa		14.83	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	14.83	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	14.83	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		14.83	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		14.83	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	14.83	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		14.83	□□□□□ -0.04

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