RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578501.5

CSNK1D-208, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 1,124 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-208	ENST00000578501	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	KIAA1191	Q96A73	305 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	SPSB2	Q99619	263 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	EGFL8	Q99944	293 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	DRC3	Q9H069	523 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	ACSS2	Q9NR19	701 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	CTSF	Q9UBX1	484 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	BSN	Q9UPA5	3926 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	TRBC2	A0A5B9	178 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	CCDC189	A1A4V9	331 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	BLACE	A4D250	179 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	ARGFX	A6NJG6	315 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	PEX12	O00623	359 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	P2RX6	O15547	441 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	FOXS1	O43638	330 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	GGT5	P36269	586 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	BCL6	P41182	706 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC6A12	P48065	614 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	OCA2	Q04671	838 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	ATP1A4	Q13733	1029 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	CSHL1	Q14406	222 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	12.97	□□□□□ -0.33	5e-7	■■□□□ 13.2
CSNK1D-208	ENST00000578501	CPZ	Q66K79	652 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	GPSM1	Q86YR5	675 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	NEIL2	Q969S2	332 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	PELI2	Q9HAT8	420 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	NOTCH2	Q04721	2471 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	FEZF1	A0PJY2	475 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	HMX2	A2RU54	273 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501		H0YIG0	161 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	AGPS	O00116	658 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	DNAJB5	O75953	348 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	AHR	P35869	848 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	PWP1	Q13610	501 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLMAP	Q14BN4	828 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR4D1	Q15615	310 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	RAPH1	Q70E73	1250 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	ASPG	Q86U10	573 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	ISCA2	Q86U28	154 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	ATCAY	Q86WG3	371 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	IFT20	Q8IY31	132 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	AMER3	Q8N944	861 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	PDPR	Q8NCN5	879 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	MIEF2	Q96C03	454 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	VPS50	Q96JG6	964 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	FLNC	Q14315	2725 aa		12.95	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501		A0A087X1B8	175 aa		12.95	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	PCDH17	O14917	1159 aa		12.95	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR1F1	O43749	312 aa		12.95	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	WDR47	O94967	919 aa		12.95	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	ACSL3	O95573	720 aa		12.95	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34

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