RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553944.2

ACTN1-AS1-201, ACTN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ACTN1-AS1, Length 484 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TUBB1Q9H4B7 451 aa8.11□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SMOC1Q9H4F8 434 aa8.11□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 AKTIPQ9H8T0 292 aa8.11□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PRM3Q9NNZ6 103 aa8.11□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TMEM9BQ9NQ34 198 aa8.11□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 C1GALT1Q9NS00 363 aa8.11□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 HEY2Q9UBP5 337 aa8.11□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 POMT2Q9UKY4 750 aa8.11□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 BTRCQ9Y297 605 aa8.11□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 VPS13AQ96RL7 3174 aa8.11□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CACNA1AO00555 2505 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FEZF1A0PJY2 475 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CPED1A4D0V7 1026 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 OR2A25A4D2G3 310 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TLCD2A6NGC4 264 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 EBAG9O00559 213 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 UBDO15205 165 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 B4GAT1O43505 415 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GDF9O60383 454 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CLEC3AO75596 197 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ATP6AP2O75787 350 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 JUNP05412 331 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PRR35P0CG20 571 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 EZRP15311 586 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CKMT2P17540 419 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CDH3P22223 829 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SCTRP47872 440 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 HTR6P50406 440 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NEK2P51955 445 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ARFIP1P53367 373 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LIMK1P53667 647 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 OR1D5P58170 312 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 YBX1P67809 324 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 EMX2Q04743 252 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TUBB3Q13509 450 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NR6A1Q15406 480 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PROX2Q3B8N5 592 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SPDYAQ5MJ70 313 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MANEAQ5SRI9 462 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TCEAL6Q6IPX3 200 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 OGFOD2Q6N063 350 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 IRGCQ6NXR0 463 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SCIMPQ6UWF3 145 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CHSY3Q70JA7 882 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PAQR7Q86WK9 346 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MFSD9Q8NBP5 474 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 HUS1BQ8NHY5 278 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SLC39A7Q92504 469 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TCEAL3Q969E4 200 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CCDC74AQ96AQ1 378 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CMTM7Q96FZ5 175 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 C3orf30Q96M34 536 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 OR52B2Q96RD2 323 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SERPINI1Q99574 410 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CENPKQ9BS16 269 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SLC6A20Q9NP91 592 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 AHSPQ9NZD4 102 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 VPS29Q9UBQ0 182 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZFP69BQ9UJL9 534 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TMED5Q9Y3A6 229 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CCL27Q9Y4X3 112 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MYO15AQ9UKN7 3530 aa8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KNL1Q8NG31 2342 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MAGEB17A8MXT2 336 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TXNDC9O14530 226 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LSM1O15116 133 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PEX11AO75192 247 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SEC22BO75396 215 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MYO1DO94832 1006 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CPNE6O95741 557 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 C9P02748 559 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GP1BAP07359 652 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ACPPP15309 386 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MAGP20916 626 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MAPK1P28482 360 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CD1CP29017 333 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ATP4BP51164 291 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RPS13P62277 151 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms