RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 ANKRD33BA6NCL7 494 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 AGRPO00253 132 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 CTSBP07858 339 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 TPSB2P20231 275 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 SF1Q15637 639 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 TPSAB1Q15661 275 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 CDKL4Q5MAI5 379 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 FRMPD2BQ6IN97 320 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 CASC4Q6P4E1 433 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 LINC00696Q6ZRV3 163 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 DNAAF3Q8N9W5 541 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 ISL2Q96A47 359 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 IL22Q9GZX6 179 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 KCNK13Q9HB14 408 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 CATSPERZQ9NTU4 200 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 RNF6Q9Y252 685 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 TRBC2A0A5B9 178 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 MAGEB16A2A368 324 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 GABRR3A8MPY1 467 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 PROM1O43490 865 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 MFAP3LO75121 409 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 CATP04040 527 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 MLNP12872 115 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 ABOP16442 354 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF24P17028 368 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 SSR1P43307 286 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 CDKL1Q00532 357 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 TTLL9Q3SXZ7 439 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 CMPK2Q5EBM0 449 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 TBC1D19Q8N5T2 526 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 MORN4Q8NDC4 146 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 SCYL1Q96KG9 808 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 LPAR4Q99677 370 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 OSBPL8Q9BZF1 889 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 ICE1Q9Y2F5 2266 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 FBN2P35556 2912 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 NAV2Q8IVL1 2488 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC189A1A4V9 331 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 F5H423 210 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 GOT2P00505 430 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 C8GP07360 202 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 TPM1P09493 284 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 KLK2P20151 261 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 ALAS2P22557 587 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 HOXC12P31275 282 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 CYB561P49447 251 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 RWDD2BP57060 319 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 UBASH3AP57075 661 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 KRTAP10-9P60411 292 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 PPP2R2AP63151 447 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 TBCELQ5QJ74 424 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 CATSPEREQ5SY80 951 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 ARSKQ6UWY0 536 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 VSTM4Q8IW00 320 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 FAM109AQ8N4B1 249 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 ACTL9Q8TC94 416 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 AGAP11Q8TF27 550 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 IGFBPL1Q8WX77 278 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 ASB11Q8WXH4 323 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 LPGAT1Q92604 370 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 SGCZQ96LD1 299 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 SH3GL2Q99962 352 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 TEX15Q9BXT5 2789 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 FIGNL2A6NMB9 653 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 A6NNC1 897 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 ACOT7O00154 380 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 RHOXF2BP0C7M4 288 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 RBP3P10745 1247 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 CNR1P21554 472 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 GPR143P51810 404 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 EFNA3P52797 238 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 E2F2Q14209 437 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 DEFB113Q30KQ7 82 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 DEFB110Q30KQ9 67 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 C1orf185Q5T7R7 199 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 DUPD1Q68J44 220 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 CPNE8Q86YQ8 564 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 CEP97Q8IW35 865 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 SYCE1Q8N0S2 351 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 CNPY4Q8N129 248 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 KCNJ9Q92806 393 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 KIAA1191Q96A73 305 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM125Q96AQ2 219 aa7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.2 ms