RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 SCN1BQ07699 218 aa3.65□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 IL10RBQ08334 325 aa3.65□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 SGCGQ13326 291 aa3.65□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 MTF1Q14872 753 aa3.65□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 WLSQ5T9L3 541 aa3.65□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 FUT10Q6P4F1 479 aa3.65□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 KLHL7Q8IXQ5 586 aa3.65□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 OR8H3Q8N146 312 aa3.65□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 GPC2Q8N158 579 aa3.65□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 FAM89BQ8N5H3 189 aa3.65□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 TCEANCQ8N8B7 351 aa3.65□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 ZNF519Q8TB69 540 aa3.65□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 ZNRF4Q8WWF5 429 aa3.65□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 C2orf48Q96LS8 159 aa3.65□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 CCDC114Q96M63 670 aa3.65□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 USP28Q96RU2 1077 aa3.65□□□□□ -1.83
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RBM39-211ENST00000426951 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa3.65□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 A0A1W2PRQ8 180 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 MTMR11A4FU01 709 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 TMEM150CB9EJG8 249 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 E5RGE8 158 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 SELENOFO60613 162 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 IGHEP01854 428 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 CD59P13987 128 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 DCDC1P59894 354 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 ROR1Q01973 937 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 BFSP1Q12934 665 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 PTK6Q13882 451 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 CDO1Q16878 200 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 FAM46CQ5VWP2 391 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 NOTUMQ6P988 496 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 KRT77Q7Z794 578 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 CORO2AQ92828 525 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 DNASE1L2Q92874 299 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 SLCO2A1Q92959 643 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 MR1Q95460 341 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 WBP2Q969T9 261 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 NXPE2Q96DL1 559 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 ERO1AQ96HE7 468 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 LINC00479Q96M42 142 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 FAM218AQ96MZ4 157 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 NEDD4LQ96PU5 975 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 KRT12Q99456 494 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 ADPGKQ9BRR6 497 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 GFRA4Q9GZZ7 299 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 TBC1D13Q9NVG8 400 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 HACD3Q9P035 362 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 DNAJB9Q9UBS3 223 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 IL36AQ9UHA7 158 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 GMEB2Q9UKD1 530 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 GTF3C4Q9UKN8 822 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 NSG2Q9Y328 171 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa3.64□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.63□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 TRAV18A0A075B6X5 111 aa3.63□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa3.63□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 ST8SIA3O43173 380 aa3.63□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 C9P02748 559 aa3.63□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 RLN1P04808 185 aa3.63□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 SERPINB2P05120 415 aa3.63□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa3.63□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 EEF2P13639 858 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 SP100P23497 879 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP3.63□□□□□ -1.832e-8■■■■■ 27.5
RBM39-211ENST00000426951 TSFMP43897 325 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 KCNJ1P48048 391 aa3.63□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 CLDN17P56750 224 aa3.63□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP3.63□□□□□ -1.834e-15■■■■□ 20.7
RBM39-211ENST00000426951 SCARB2Q14108 478 aa3.63□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 FCN2Q15485 313 aa3.63□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa3.63□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 HECTD3Q5T447 861 aa3.63□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 CES4AQ5XG92 561 aa3.63□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 NCOA7Q8NI08 942 aa3.63□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 GRK7Q8WTQ7 553 aa3.63□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 ZNF599Q96NL3 588 aa3.63□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 SYT11Q9BT88 431 aa3.63□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 ZWILCHQ9H900 591 aa3.63□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 ASIC3Q9UHC3 531 aa3.63□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 PILRBQ9UKJ0 227 aa3.63□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 ITGA11Q9UKX5 1188 aa3.63□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 KLK4Q9Y5K2 254 aa3.63□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 SELENOKQ9Y6D0 94 aa3.63□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa3.63□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 NDUFAF8A1L188 74 aa3.62□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 CYTIPO60759 359 aa3.62□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 SLU7O95391 586 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RBM39-211ENST00000426951 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
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