RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FBP2O00757 339 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CLDN4O14493 209 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 UGT1A9O60656 530 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RP2O75695 350 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 H6PDO95479 791 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SEMA4FO95754 770 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 C9P02748 559 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC35G6P0C7Q6 338 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 UMPSP11172 480 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PSKH1P11801 424 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 GNAZP19086 355 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 UGT1A6P19224 532 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TPSB2P20231 275 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 C5AR1P21730 350 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 UGT1A1P22309 533 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 UGT1A4P22310 534 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PPIBP23284 216 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 VAMP1P23763 118 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 GADD45AP24522 165 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 VARSP26640 1264 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 UGT1A3P35503 534 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PBX2P40425 430 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SEMG2Q02383 582 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MVKQ03426 396 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 DSC1Q08554 894 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TPSAB1Q15661 275 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZBED5Q49AG3 693 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MINDY4Q4G0A6 757 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF805Q5CZA5 627 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 HGSNATQ68CP4 663 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 LRRN1Q6UXK5 716 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 OAFQ86UD1 273 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC9B2Q86UD5 537 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 LRRTM3Q86VH5 581 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 LAPTM4BQ86VI4 370 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RASGRP3Q8IV61 690 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MFSD6LQ8IWD5 586 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PDZD9Q8IXQ8 264 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PRELID2Q8N945 189 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SETD6Q8TBK2 473 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TCP10LQ8TDR4 215 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 GIMAP5Q96F15 307 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FCRL5Q96RD9 977 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PPA2Q9H2U2 334 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 DPAGT1Q9H3H5 408 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 UGT1A7Q9HAW7 530 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 UGT1A10Q9HAW8 530 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 UGT1A8Q9HAW9 530 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FKBPLQ9UIM3 349 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CDC14AQ9UNH5 594 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 OR10H1Q9Y4A9 318 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 NUMBLQ9Y6R0 609 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 A0A1W2PQU0 124 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM86C2PA6NEL3 165 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 EFCAB7A8K855 629 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 C12orf71A8MTZ7 269 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 LEFTY1O75610 366 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CNTN5O94779 1100 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 AP2A2O94973 939 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PRKCGP05129 697 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SERPINA6P08185 405 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CD48P09326 243 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 GTF2F2P13984 249 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TSHRP16473 764 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CD72P21854 359 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 HOXA9P31269 272 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 HOXD12P35452 270 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 HOXD13P35453 343 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 HPCAL1P37235 193 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CCNFP41002 786 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PTGER3P43115 390 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SSR2P43308 183 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ALDH3B2P48448 385 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ETV1P50549 477 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RAB5CP51148 216 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SUOXP51687 545 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MGAT3Q09327 533 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PON3Q15166 354 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CST6Q15828 149 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 DUSP6Q16828 381 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ANKDD1AQ495B1 522 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa4.29□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms