RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 ADGRG5Q8IZF4 528 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 TRPV3Q8NET8 790 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 OR8J3Q8NGG0 315 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 GATA6Q92908 595 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 MIEF2Q96C03 454 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SIPA1Q96FS4 1042 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ITCHQ96J02 903 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF145Q96MT1 663 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 GBP5Q96PP8 586 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 BTBD9Q96Q07 612 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 FERD3LQ96RJ6 166 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC29A1Q99808 456 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CENPKQ9BS16 269 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SGPP1Q9BX95 441 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 TEX101Q9BY14 249 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 RBCK1Q9BYM8 510 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SPNS1Q9H2V7 528 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 OR51B5Q9H339 312 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 MUC13Q9H3R2 512 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ARMC1Q9NVT9 282 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PIAS3Q9Y6X2 628 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CROCCQ5TZA2 2017 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PIPSLA2A3N6 862 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 A6NJY4 79 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 NPIPB8E9PQR5 432 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ERN1O75460 977 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 LYNP07948 512 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 LAMP1P11279 417 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CDH1P12830 882 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 HSD3B1P14060 373 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CD72P21854 359 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 HSD3B2P26439 372 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ADPRHP54922 357 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PRKCQQ04759 706 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF33BQ06732 778 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 UGT8Q16880 541 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 HKDC1Q2TB90 917 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM31Q5JXX7 168 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 C6orf52Q5T4I8 152 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF621Q6ZSS3 439 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ERMP1Q7Z2K6 904 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 RIMKLAQ8IXN7 391 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SNX19Q92543 992 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 TTC9Q92623 222 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 TESCQ96BS2 214 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 REPS1Q96D71 796 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ABHD8Q96I13 439 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 MSLNLQ96KJ4 702 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 C12orf66Q96MD2 445 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PANX1Q96RD7 426 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SH3GL1Q99961 368 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 EFCAB11Q9BUY7 163 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNH6Q9H252 994 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 BRF2Q9HAW0 419 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CD93Q9NPY3 652 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SERHLQ9NQF3 203 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SH3BP4Q9P0V3 963 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 TAC3Q9UHF0 121 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SCOCQ9UIL1 159 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ANAPC2Q9UJX6 822 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 BTBD3Q9Y2F9 522 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 WDR37Q9Y2I8 494 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 AP4B1Q9Y6B7 739 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A096LPI6 279 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 TCRBV5S2A0A599 114 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ELOVL7A1L3X0 281 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 C7orf72A4D263 438 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 DPPA5A6NC42 116 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PDZK1P1A8MUH7 402 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ANHXE9PGG2 379 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PDLIM1O00151 329 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 FPGTO14772 594 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PCDH7O60245 1069 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 IL2RAP01589 272 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 C1QCP02747 245 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 RPN2P04844 631 aa3.83□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms