RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391266.1

RNU6-1254P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1254, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1254P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NFKBIDQ8NI38 313 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 EXOC4Q96A65 974 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 C16orf74Q96GX8 76 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 C8orf48Q96LL4 319 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RUNDC3BQ96NL0 473 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 OR2A14Q96R47 310 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CCT8L2Q96SF2 557 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MTMR12Q9C0I1 747 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ING2Q9H160 280 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 EGLN3Q9H6Z9 239 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 DNAJC18Q9H819 358 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 Q9N2K0 584 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SETD4Q9NVD3 440 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KLK11Q9UBX7 282 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MMACHCQ9Y4U1 282 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NEDD4P46934 1319 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LRRK1Q38SD2 2015 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 BRWD3Q6RI45 1802 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FEZF1A0PJY2 475 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SAP18O00422 153 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RTCAO00442 366 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TNFSF12O43508 249 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 AIREO43918 545 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MED24O75448 989 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CREG1O75629 220 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ACTN1P12814 892 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CD99P14209 185 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PRLRP16471 622 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 OAS2P29728 719 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PRKAR2BP31323 418 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PBX3P40426 434 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 HARS2P49590 506 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NDST1P52848 882 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RARSP54136 660 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 EIF5P55010 431 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 OR1D5P58170 312 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PAX2Q02962 417 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NIPAL4Q0D2K0 466 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GPR68Q15743 365 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PCK2Q16822 640 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PCGF3Q3KNV8 242 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SYT14P1Q58G82 188 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KRT79Q5XKE5 535 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FAAH2Q6GMR7 532 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ARMCX5Q6P1M9 558 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 C1orf228Q6PIY5 440 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FIGLAQ6QHK4 219 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CYP20A1Q6UW02 462 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CLEC17AQ6ZS10 378 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MCM10Q7L590 875 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MMD2Q8IY49 270 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TMTC2Q8N394 836 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GPR137CQ8N3F9 429 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 THAP8Q8NA92 274 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 OR9Q2Q8NGE9 314 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 OR1B1Q8NGR6 318 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PIK3R3Q92569 461 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SMARCE1Q969G3 411 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TADA1Q96BN2 335 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FAM149B1Q96BN6 582 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ELMOD3Q96FG2 381 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PERPQ96FX8 193 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 VSIG2Q96IQ7 327 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FNDC11Q9BVV2 318 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 WDR41Q9HAD4 459 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RIC8AQ9NPQ8 531 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GKN1Q9NS71 199 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 DEPPQ9NTK1 212 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TAS2R14Q9NYV8 317 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KLRF1Q9NZS2 232 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 THYN1Q9P016 225 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 HACD3Q9P035 362 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PHF11Q9UIL8 331 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF229Q9UJW7 825 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NENFQ9UMX5 172 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 IGSF1Q8N6C5 1336 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 A0A087WZ39 114 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 A0A0U1RQS6 177 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 A0A1W2PR77 199 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CCDC189A1A4V9 331 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MFSD2BA6NFX1 497 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TMEM221A6NGB7 291 aa0.05□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms