RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 PPM1JQ5JR12 505 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 BORAQ6PGQ7 559 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 ANKRD46Q86W74 232 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 SH3RF2Q8TEC5 729 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 HSH2DQ96JZ2 352 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 NECTIN4Q96NY8 510 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 ZBTB26Q9HCK0 441 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 TESMINQ9Y4I5 508 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 ISPDA4D126 451 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 L7N2F9 121 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 DNAJB6O75190 326 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 FESP07332 822 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 UQCRC2P22695 453 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 FSHRP23945 695 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 GSTM2P28161 218 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 VAMP2P63027 116 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 SLC18A2Q05940 514 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 ELP5Q8TE02 316 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 LRTOMTQ8WZ04 291 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 SLC4A9Q96Q91 983 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 ADAMTS10Q9H324 1103 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 EVA1AQ9H8M9 152 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 GPR25O00155 361 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 PEX12O00623 359 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 FARS2O95363 451 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 PSKH1P11801 424 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 GRIK2Q13002 908 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 RABEPKQ7Z6M1 372 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 YIPF7Q8N8F6 280 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 THAP6Q8TBB0 222 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 C10orf82Q8WW14 230 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 ZDHHC12Q96GR4 267 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 GRHPRQ9UBQ7 328 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 DKKL1Q9UK85 242 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 SEC16AO15027 2179 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 LAMB1P07942 1786 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 S1PR1P21453 382 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 UGT1A4P22310 534 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 RYKP34925 604 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 NFE2L1Q14494 772 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 MYLK3Q32MK0 819 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 TRAM1L1Q8N609 369 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 FAM46DQ8NEK8 389 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 RANBP9Q96S59 729 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRT-201ENST00000356100 PHF24Q9UPV7 400 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 MGAT4BQ9UQ53 548 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 SH3D21A4FU49 640 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 ARVCFO00192 962 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 PRAMEF11O60813 436 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 GP1BBP13224 206 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 CHRNB2P17787 502 aa5.84□□□□□ -1.47
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PTPRT-201ENST00000356100 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 SAPCD2Q86UD0 394 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 CEP97Q8IW35 865 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF440Q8IYI8 595 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 ERLEC1Q96DZ1 483 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 VRTNQ9H8Y1 702 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 RDH8Q9NYR8 311 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 HTR3EA5X5Y0 456 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 M0R129 80 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 NOBOXO60393 691 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 MAGEA2P43356 314 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 CYP4F8P98187 520 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP5.84□□□□□ -1.476e-14■■■■■ 61.7
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PTPRT-201ENST00000356100 RTL10Q7L3V2 364 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 KBTBD6Q86V97 674 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 MINDY3Q9H8M7 445 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 TDP1Q9NUW8 608 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 MANBAO00462 879 aa5.84□□□□□ -1.47
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PTPRT-201ENST00000356100 AHSA1O95433 338 aa5.84□□□□□ -1.47
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PTPRT-201ENST00000356100 NRSN1Q8IZ57 195 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 GALNT15Q8N3T1 639 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 HDHD5Q9BXW7 423 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 TAS2R9Q9NYW1 312 aa5.84□□□□□ -1.47
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