RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345807.6

CLTB-202, Transcript of clathrin light chain B, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLTB, Length 1,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTB-202ENST00000345807 PPP1R7Q15435 360 aa21.5■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 AGTRAPQ6RW13 159 aa21.5■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa21.5■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 PRSS41Q7RTY9 318 aa21.5■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 PALM2Q8IXS6 379 aa21.5■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 METTL21AQ8WXB1 218 aa21.5■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 THAP11Q96EK4 314 aa21.5■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 MACROD1Q9BQ69 325 aa21.5■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 TUBB6Q9BUF5 446 aa21.5■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 VN1R1Q9GZP7 353 aa21.5■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 PARVBQ9HBI1 364 aa21.5■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 TAS2R13Q9NYV9 303 aa21.5■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 SH2B3Q9UQQ2 575 aa21.5■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 F10P00742 488 aa21.49■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 PER3P56645 1201 aa21.49■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 SP140Q13342 867 aa21.49■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 MFSD4BQ5TF39 518 aa21.49■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 PAQR3Q6TCH7 311 aa21.49■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 C17orf64Q86WR6 236 aa21.49■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 MYO1HQ8N1T3 1032 aa21.49■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 SLC35F6Q8N357 371 aa21.49■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 AMER2Q8N7J2 671 aa21.49■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 IMMP1LQ96LU5 166 aa21.49■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 ATG10Q9H0Y0 220 aa21.49■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa21.48■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 FEZF1A0PJY2 475 aa21.48■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 SLC16A5O15375 505 aa21.48■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 BANF1O75531 89 aa21.48■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 TTC4O95801 387 aa21.48■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 WDPCPO95876 746 aa21.48■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 IL1RNP18510 177 aa21.48■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 GABRB3P28472 473 aa21.48■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 NAE1Q13564 534 aa21.48■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 INAQ16352 499 aa21.48■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 MINDY4Q4G0A6 757 aa21.48■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 CAMKVQ8NCB2 501 aa21.48■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 OR51Q1Q8NH59 317 aa21.48■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 TM4SF19Q96DZ7 209 aa21.48■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 TAAR6Q96RI8 345 aa21.48■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 HCN3Q9P1Z3 774 aa21.48■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 SGK494L7N484 410 aa21.47■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 CYC1P08574 325 aa21.47■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 CCND1P24385 295 aa21.47■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 BCL6P41182 706 aa21.47■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 XCR1P46094 333 aa21.47■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 CDKN2DP55273 166 aa21.47■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 SPANXN3Q5MJ09 141 aa21.47■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 ABHD17BQ5VST6 288 aa21.47■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 LCTLQ6UWM7 567 aa21.47■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 LANCL3Q6ZV70 420 aa21.47■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 ASPGQ86U10 573 aa21.47■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 SHISA5Q8N114 240 aa21.47■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa21.47■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 LINGO1Q96FE5 620 aa21.47■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 CYTH2Q99418 400 aa21.47■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 SGPP1Q9BX95 441 aa21.47■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 RNF32Q9H0A6 362 aa21.47■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 ANKHQ9HCJ1 492 aa21.47■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 ASIC3Q9UHC3 531 aa21.47■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa21.46■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 AHSGP02765 367 aa21.46■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 STSP08842 583 aa21.46■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 CDH1P12830 882 aa21.46■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 PHKG1Q16816 387 aa21.46■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 MSS51Q4VC12 460 aa21.46■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 SLC26A11Q86WA9 606 aa21.46■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 CNTN4Q8IWV2 1026 aa21.46■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 KCT2Q8NC54 265 aa21.46■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 SLC13A3Q8WWT9 602 aa21.46■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 NR4A3Q92570 626 aa21.46■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 NAT9Q9BTE0 207 aa21.46■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 TEKT2Q9UIF3 430 aa21.46■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 SNX12Q9UMY4 172 aa21.46■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 CROCCQ5TZA2 2017 aa21.46■■□□□ 1.03
CLTB-202ENST00000345807 CENPEQ02224 2701 aa21.45■■□□□ 1.02
CLTB-202ENST00000345807 CES2O00748 559 aa21.45■■□□□ 1.02
CLTB-202ENST00000345807 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CLTB-202ENST00000345807 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CLTB-202ENST00000345807 NPPBP16860 134 aa21.45■■□□□ 1.02
CLTB-202ENST00000345807 HIST1H2ADP20671 130 aa21.45■■□□□ 1.02
CLTB-202ENST00000345807 GRK3P35626 688 aa21.45■■□□□ 1.02
CLTB-202ENST00000345807 TDGF1P3P51864 188 aa21.45■■□□□ 1.02
CLTB-202ENST00000345807 ZNF33BQ06732 778 aa21.45■■□□□ 1.02
CLTB-202ENST00000345807 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CLTB-202ENST00000345807 KIAA0408Q6ZU52 694 aa21.45■■□□□ 1.02
CLTB-202ENST00000345807 PCGF5Q86SE9 256 aa21.45■■□□□ 1.02
CLTB-202ENST00000345807 ZGRF1Q86YA3 2104 aa21.45■■□□□ 1.02
CLTB-202ENST00000345807 SUN3Q8TAQ9 357 aa21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms