RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323929.7

MRE11-201, Transcript of MRE11 homolog, double strand break repair nuclease, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene MRE11, Length 6,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11-201ENST00000323929 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 ANGPTL1O95841 491 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 HMGN1P05114 100 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 NR2C1P13056 603 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 GLDCP23378 1020 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 HOXC12P31275 282 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 KCNC1P48547 511 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 GBX1Q14549 363 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 KLHL26Q53HC5 615 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 NXPE4Q6UWF7 544 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 TMEM126BQ8IUX1 230 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 CLDN19Q8N6F1 224 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 C3orf58Q8NDZ4 430 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 OR10G2Q8NGC3 310 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 NFKBIDQ8NI38 313 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 PYURFQ96I23 114 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 KCNC2Q96PR1 638 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 CD320Q9NPF0 282 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 C11orf16Q9NQ32 467 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 TMEM45AQ9NWC5 275 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 AKAP11Q9UKA4 1901 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 PDCD5O14737 125 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 SERPINA3P01011 423 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 PDYNP01213 254 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 HEXBP07686 556 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 SYPP08247 313 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 MTTPP55157 894 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 DSC1Q08554 894 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 IL18R1Q13478 541 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 SLC30A6Q6NXT4 461 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 TMEM25Q86YD3 366 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 COMMD4Q9H0A8 199 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 PRKAB1Q9Y478 270 aa7.3□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 BCHEP06276 602 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 SLC35E2BP0CK96 405 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 CXCR1P25024 350 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 GSTM2P28161 218 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 S100GP29377 79 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 SDC2P34741 201 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 TNFRSF4P43489 277 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 UNC50Q53HI1 259 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 GPR107Q5VW38 600 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 POMZP3Q6PJE2 187 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 SYVN1Q86TM6 617 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 GPR65Q8IYL9 337 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 TTC9BQ8N6N2 239 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 OR52J3Q8NH60 311 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 NCSTNQ92542 709 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 IFT27Q9BW83 186 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 GPR174Q9BXC1 333 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 ACTR3BQ9P1U1 418 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 PRODH2Q9UF12 536 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 EDIL3O43854 480 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 SEMA4FO95754 770 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 SLC6A4P31645 630 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 VIPR2P41587 438 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 DAG1Q14118 895 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 ATG9BQ674R7 924 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 HACD2Q6Y1H2 254 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 SNX33Q8WV41 574 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 NELL2Q99435 816 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 ZBP1Q9H171 429 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 IFT52Q9Y366 437 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 FOSL2P15408 326 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 ZNF3P17036 446 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 FBLP22087 321 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 CDK6Q00534 326 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 AMIGO1Q86WK6 493 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 IZUMO1Q8IYV9 350 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 FBXL8Q96CD0 374 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 CCDC106Q9BWC9 280 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-201ENST00000323929 OSBPL7Q9BZF2 842 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms