RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317118.12

PDE4D-202, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-202ENST00000317118 RNF44Q7L0R7 432 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 MAVSQ7Z434 540 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 PRSS42Q7Z5A4 293 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 KMT5CQ86Y97 462 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 OR7G3Q8NG95 312 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 OR2I1PQ8NGU4 316 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 FRG2BQ96QU4 278 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 KCNA7Q96RP8 456 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 CDC6Q99741 560 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 DPH7Q9BTV6 452 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 TUBB1Q9H4B7 451 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 ELOVL6Q9H5J4 265 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 NPHS2Q9NP85 383 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 PARD6AQ9NPB6 346 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 MRGBPQ9NV56 204 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 SIRT5Q9NXA8 310 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 CCL27Q9Y4X3 112 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 TMEM233B4DJY2 109 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 H7BY64 318 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 RGS14O43566 566 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 CLEC3AO75596 197 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 ANKRD34CP0C6C1 535 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 PRR35P0CG20 571 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 KITP10721 976 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 ACPPP15309 386 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 MAGEA8P43361 318 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 IDH3AP50213 366 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 ARFIP2P53365 341 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 OR1D5P58170 312 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 TMEM95Q3KNT9 176 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 MANEAQ5SRI9 462 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 FCRL6Q6DN72 434 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 GUSBP11Q6P575 273 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 FIGLAQ6QHK4 219 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 GLRX5Q86SX6 157 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 NAXDQ8IW45 347 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 MFSD9Q8NBP5 474 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 IFI44Q8TCB0 444 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 BCAS4Q8TDM0 211 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 RHBDD1Q8TEB9 315 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 C10orf82Q8WW14 230 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 C17orf50Q8WW18 174 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 SELENOMQ8WWX9 145 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 C19orf60Q96EN9 201 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 TCTN2Q96GX1 697 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 PRAP1Q96NZ9 151 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 CCDC3Q9BQI4 270 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 ACAT2Q9BWD1 397 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 LRRN3Q9H3W5 708 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 RIC8BQ9NVN3 520 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 NMRK1Q9NWW6 199 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 PILRAQ9UKJ1 303 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 BTBD3Q9Y2F9 522 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 TIMM22Q9Y584 194 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 CACNA1EQ15878 2313 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-202ENST00000317118 SDHDO14521 159 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-202ENST00000317118 NDUFAB1O14561 156 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-202ENST00000317118 PIP5K1BO14986 540 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-202ENST00000317118 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-202ENST00000317118 INMTO95050 263 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-202ENST00000317118 CPNE6O95741 557 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-202ENST00000317118 PDYNP01213 254 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-202ENST00000317118 CDK4P11802 303 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-202ENST00000317118 TYRP1P17643 537 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-202ENST00000317118 SERPINB3P29508 390 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-202ENST00000317118 ALDH4A1P30038 563 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-202ENST00000317118 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-202ENST00000317118 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-202ENST00000317118 DAB2P98082 770 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-202ENST00000317118 CFHR1Q03591 330 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-202ENST00000317118 PWP1Q13610 501 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-202ENST00000317118 CUL3Q13618 768 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-202ENST00000317118 ABRAXAS2Q15018 415 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-202ENST00000317118 ZIC1Q15915 447 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-202ENST00000317118 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-202ENST00000317118 PERM1Q5SV97 790 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-202ENST00000317118 OGFOD2Q6N063 350 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-202ENST00000317118 Q6ZSR9 355 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-202ENST00000317118 ACAD11Q709F0 780 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-202ENST00000317118 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-202ENST00000317118 PIP4P1Q86T03 277 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-202ENST00000317118 TRIM73Q86UV7 250 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-202ENST00000317118 TRPV3Q8NET8 790 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-202ENST00000317118 OR4D9Q8NGE8 314 aa5.65□□□□□ -1.51
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