RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
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TRIM54-201ENST00000296098 PDGFRLQ15198 375 aa23.09■■□□□ 1.29
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TRIM54-201ENST00000296098 HIPK1Q86Z02 1210 aa23.09■■□□□ 1.29
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TRIM54-201ENST00000296098 C11orf96Q7Z7L8 435 aa23.06■■□□□ 1.28
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TRIM54-201ENST00000296098 ORC6Q9Y5N6 252 aa23.06■■□□□ 1.28
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TRIM54-201ENST00000296098 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa23.06■■□□□ 1.28
TRIM54-201ENST00000296098 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
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TRIM54-201ENST00000296098 EN2P19622 333 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
TRIM54-201ENST00000296098 PRKACGP22612 351 aa23.05■■□□□ 1.28
TRIM54-201ENST00000296098 FCARP24071 287 aa23.05■■□□□ 1.28
TRIM54-201ENST00000296098 OPRD1P41143 372 aa23.05■■□□□ 1.28
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