RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249440.4

HOXD3-201, Transcript of homeobox D3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD3, Length 2,303 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3-201ENST00000249440 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
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HOXD3-201ENST00000249440 TMEM25Q86YD3 366 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXD3-201ENST00000249440 OR2A12Q8NGT7 310 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXD3-201ENST00000249440 TMEM159Q96B96 161 aa15.85■□□□□ 0.13
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HOXD3-201ENST00000249440 PRSS48Q7RTY5 328 aa15.84■□□□□ 0.13
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HOXD3-201ENST00000249440 C7orf34Q96L11 122 aa15.84■□□□□ 0.13
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HOXD3-201ENST00000249440 CHST8Q9H2A9 424 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD3-201ENST00000249440 RUBCNLQ9H714 662 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD3-201ENST00000249440 ACOT13Q9NPJ3 140 aa15.84■□□□□ 0.13
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HOXD3-201ENST00000249440 CHD7Q9P2D1 2997 aa15.84■□□□□ 0.13
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HOXD3-201ENST00000249440 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
HOXD3-201ENST00000249440 NIPAL1Q6NVV3 410 aa15.83■□□□□ 0.12
HOXD3-201ENST00000249440 CCDC149Q6ZUS6 474 aa15.83■□□□□ 0.12
HOXD3-201ENST00000249440 NPAS3Q8IXF0 933 aa15.83■□□□□ 0.12
HOXD3-201ENST00000249440 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa15.83■□□□□ 0.12
HOXD3-201ENST00000249440 OR4K3Q96R72 315 aa15.83■□□□□ 0.12
HOXD3-201ENST00000249440 PITX2Q99697 317 aa15.83■□□□□ 0.12
HOXD3-201ENST00000249440 FAM83CQ9BQN1 747 aa15.83■□□□□ 0.12
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