RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249377.4

LRRC17-201, Transcript of leucine rich repeat containing 17, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC17, Length 2,002 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17-201ENST00000249377 LRRC26Q2I0M4 334 aa13.14□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 CDKL4Q5MAI5 379 aa13.14□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 MACC1Q6ZN28 852 aa13.14□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa13.14□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 ZNF367Q7RTV3 350 aa13.14□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa13.14□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 TTC16Q8NEE8 873 aa13.14□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 DENND6BQ8NEG7 585 aa13.14□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 ADAM2Q99965 735 aa13.14□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa13.14□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 CHST8Q9H2A9 424 aa13.14□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 RAD18Q9NS91 495 aa13.14□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 GPR83Q9NYM4 423 aa13.14□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 ZNF226Q9NYT6 803 aa13.14□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa13.14□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 TBKBP1A7MCY6 615 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 TMEM229AB2RXF0 380 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 CBX4O00257 560 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 PRMT3O60678 531 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 GUCY1B2O75343 617 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 DNTTP04053 509 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 DDOSTP39656 456 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 ARHGEF7Q14155 803 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 STARD3Q14849 445 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 UGT8Q16880 541 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 LHX8Q68G74 356 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 FAM151BQ6UXP7 276 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 CLDN19Q8N6F1 224 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 FLCNQ8NFG4 579 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 TMCO6Q96DC7 493 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 OR2A14Q96R47 310 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 GPR63Q9BZJ6 419 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 ELOVL6Q9H5J4 265 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 AMBNQ9NP70 447 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 VWA8A3KMH1 1905 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 GFRA2O00451 464 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 KIAA0513O60268 411 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 ANXA5P08758 320 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 PRPS1L1P21108 318 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 ACRV1P26436 265 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 DSC1Q08554 894 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 NFATC2Q13469 925 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 CDK10Q15131 360 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 HKDC1Q2TB90 917 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 BCL7AQ4VC05 210 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 ZNF280BQ86YH2 543 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 DEPDC4Q8N2C3 294 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 STX19Q8N4C7 294 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 L3MBTL4Q8NA19 623 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 OR8J2Q8NGG1 315 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 TPD52L3Q96J77 140 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 ST6GAL2Q96JF0 529 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 SPATA17Q96L03 361 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 FEVQ99581 238 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 C19orf43Q9BQ61 176 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 SLC30A2Q9BRI3 323 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 C3orf14Q9HBI5 128 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 LATS2Q9NRM7 1088 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 TMEM184CQ9NVA4 438 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 LHX3Q9UBR4 397 aa13.13□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 UGT2B17O75795 530 aa13.12□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 SEMA3DO95025 777 aa13.12□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 COL6A1P12109 1028 aa13.12□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 TIE1P35590 1138 aa13.12□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 NUDT6P53370 316 aa13.12□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 CRISP3P54108 245 aa13.12□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 C21orf58P58505 322 aa13.12□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 DMPKQ09013 629 aa13.12□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 ST3GAL4Q11206 333 aa13.12□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 TWF1Q12792 350 aa13.12□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa13.12□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 NXNL2Q5VZ03 156 aa13.12□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 NOXRED1Q6NXP6 359 aa13.12□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 TMC5Q6UXY8 1006 aa13.12□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 CHST9Q7L1S5 443 aa13.12□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 VN1R5Q7Z5H4 357 aa13.12□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 ZNF605Q86T29 641 aa13.12□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 ATCAYQ86WG3 371 aa13.12□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 TCAIMQ8N3R3 496 aa13.12□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 GALNT6Q8NCL4 622 aa13.12□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 SIMC1Q8NDZ2 872 aa13.12□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 OR4C15Q8NGM1 316 aa13.12□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 APOLD1Q96LR9 279 aa13.12□□□□□ -0.31
LRRC17-201ENST00000249377 CDCA4Q9BXL8 241 aa13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms