RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000040783.10

Usp40-201, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp40, Length 5,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40-201ENSMUST00000040783 Dcun1d3Q8K0V2 304 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Dlgap5Q8K4R9 808 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ccdc71Q8VEG0 433 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Mfsd5Q921Y4 450 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Tas1r2Q925I4 843 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Aco2Q99KI0 780 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Q99KU6 348 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Msantd3Q9CR78 275 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Rfx5Q9JL61 658 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gp1baO35930 734 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 P01652 108 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 AldoaP05064 364 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 PrlP06879 226 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Scg5P12961 212 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 ChgbP16014 677 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Lim2P56563 173 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Serpinf1P97298 417 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Tbc1d24Q3UUG6 561 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Clca4bQ3UW98 925 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Trmt2bQ8BQJ6 493 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cfap20Q8BTU1 193 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Plin5Q8BVZ1 463 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Zbtb6Q8K088 423 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Vmn1r217Q8R270 298 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr1043Q8VFK4 314 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 D6Wsu163eQ91YN0 552 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gstt3Q99L20 241 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Mettl15Q9DCL4 406 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cngb3Q9JJZ9 694 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Vps29Q9QZ88 182 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 St6galnac4Q9R2B6 360 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 BcorQ8CGN4 1759 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm20911A0A087WSS0 222 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr239A0PK55 315 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Pramef17A2ASJ1 475 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr55K7N6Q1 315 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm8857L7N291 182 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Csnk2a2O54833 350 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Nrsn1P97799 196 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Tbrg1Q3UB74 406 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Slc39a12Q5FWH7 689 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Prkd1Q62101 918 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Itga3Q62470 1053 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Abhd10Q6PE15 297 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Oog2Q7TPX8 476 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Proser3Q7TSA6 634 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Q80VP5 184 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cars2Q8BYM8 551 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Slco6c1Q8C0X7 706 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Tmem150cQ8C8S3 249 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cers2Q924Z4 380 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ndufs4Q9CXZ1 175 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cmtm8Q9CZR4 173 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cpxm2Q9D2L5 764 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Rpl4Q9D8E6 419 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ift43Q9DA69 206 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr705Q9EPF7 316 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Extl1Q9JKV7 669 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Khdrbs3Q9R226 346 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Mad2l1Q9Z1B5 205 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Fkbp9Q9Z247 570 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Fndc3c1Q6DFV6 1356 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Lrrc10bG3XA50 292 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm20695H3BLK7 282 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Aff2O55112 1272 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Mup3P04939 184 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 OcmP51879 109 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Upf3aQ3ULJ3 422 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Bbs1Q3V3N7 593 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Heatr6Q6P1G0 1184 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Shkbp1Q6P7W2 704 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Eri3Q8C460 337 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Il17rdQ8JZL1 738 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 GrpQ8R1I2 146 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Mul1Q8VCM5 352 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr1484Q8VEU6 315 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Plpp3Q99JY8 312 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 PompQ9CQT5 141 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 PigkQ9CXY9 395 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Arl2Q9D0J4 184 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ribc2Q9D4Q1 309 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Mbd3l1Q9D9H3 186 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr630Q9EQQ7 319 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cldn19Q9ET38 224 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ing1Q9QXV3 279 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Col2a1P28481 1487 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Klhl4B1AZR0 717 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Chrna10B2RX82 447 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Zbtb10E9Q8X5 861 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Vmn2r65G3X931 845 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Pgam2O70250 253 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Sh3pxd2aO89032 1124 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Agtr2P35374 363 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cfl2P45591 166 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 TesP47226 423 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 InhbcP55104 352 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Creb1Q01147 341 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Lrrc74bQ14BP6 391 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Tmem173Q3TBT3 378 aa7.29□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Yy2Q3TTC2 378 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.2 ms