RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028398.13

Ube2e3-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2e3, Length 2,249 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rab39aQ8BHD0 217 aa21.18■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 MmaaQ8C7H1 415 aa21.18■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ifnl3Q8CGK6 193 aa21.18■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cnot3Q8K0V4 751 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 SelenomQ8VHC3 145 aa21.18■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sohlh2Q9D489 467 aa21.18■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ndufs3Q9DCT2 263 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Aldh6a1Q9EQ20 535 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cdc20Q9JJ66 499 aa21.18■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Obsl1D3YYU8 1804 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fbxo47A2A6H3 451 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ddx43D3Z6P9 646 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm8237E9Q257 205 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm8897L7N294 181 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ptch2O35595 1182 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mkln1O89050 735 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hoxa4P06798 285 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 BcheQ03311 603 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lrfn1Q2WF71 766 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Acsm3Q3UNX5 580 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Aldh16a1Q571I9 802 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Phf12Q5SPL2 1003 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fstl1Q62356 306 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hist2h2acQ64523 129 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zc3h11aQ6NZF1 792 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 FukQ7TMC8 1090 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfr1308Q7TQX0 320 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dtd2Q8BHA3 168 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfm2Q8BM13 448 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Bend7Q8BSV3 434 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mtrf1Q8K126 446 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Vmn1r6Q8R2D4 303 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fam20bQ8VCS3 409 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dhrs7Q9CXR1 338 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Clca3a1Q9QX15 902 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Adam25Q9R159 760 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dpp6Q9Z218 804 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ms4a4aA0A087WRT7 236 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm5565A0A0G2JGB2 317 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Vmn1r184E9Q2N4 314 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Vmn2r92L7N2A4 860 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 P01648 108 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fcgr2P08101 330 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ptpn22P29352 802 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gfi1P70338 423 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 G6pdxQ00612 515 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gjb5Q02739 271 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tgtp2Q3T9E4 415 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Clec12aQ504P2 267 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Arhgef15Q5FWH6 849 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zp1Q62005 623 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tgtp1Q62293 415 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tmem151bQ68FE7 561 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfr503Q7TRU8 323 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rbm11Q80YT9 238 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fbxl14Q8BID8 400 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 HopxQ8R1H0 73 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 TbccQ8VCN9 341 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tspan1Q99J59 240 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ppil1Q9D0W5 166 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tmem53Q9D0Z3 276 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rhobtb1Q9DAK3 695 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Adam21Q9JI76 729 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Inpp5eQ9JII1 647 aa21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Adh6bA0A1D5RMB0 384 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mgat4eA6H684 439 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm6337K7N6X9 211 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm3159K7N760 267 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm3115L7N285 211 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PigfO09101 219 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 ChadO55226 358 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gstm1P10649 218 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Htr1bP28334 386 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Apoa1Q00623 264 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Samd12Q0VE29 161 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 CdonQ32MD9 1250 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 BadQ61337 204 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pou4f2Q63934 411 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Krr1Q8BGA5 380 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Timm29Q8BGX2 266 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ncs1Q8BNY6 190 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Vps37aQ8CHS8 397 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Bbs2Q9CWF6 721 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 GatmQ9D964 423 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mkrn2Q9ERV1 416 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Acsl4Q9QUJ7 711 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ighv11-1A0A075B5R6 117 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kctd14A0A0U1RNG7 287 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm13088A2AGW6 460 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Acnat1A2AKK5 416 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Znf711A2ANX9 761 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm8922F6XVS9 199 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hoxc11P31313 304 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Il20raQ6PHB0 546 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Vmn2r81Q80Z09 865 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 TufmQ8BFR5 452 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Reep1Q8BGH4 201 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Epb41l5Q8BGS1 731 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Smarcal1Q8BJL0 910 aa21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 GabrpQ8QZW7 440 aa21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.3 ms