RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cpa6Q5U901 438 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Itih2Q61703 946 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc16a12Q8BGC3 486 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fignl1Q8BPY9 683 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gucy1b2Q8BXH3 824 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dcaf12l1Q8CBW4 501 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdhb21Q91V48 774 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ndufs2Q91WD5 463 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Haus5Q9D786 619 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cntd1Q9D995 334 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc70Q9D9B0 223 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Yae1d1Q9DAY6 216 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnajb9Q9QYI6 222 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mapk9Q9WTU6 423 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3854A0A1B0GSS6 495 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cped1B2RX70 1026 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10718D3Z1I7 227 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr376E9Q4M1 320 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r31L7N1Z4 861 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm6356L7N2A7 188 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stc1O55183 247 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fv4P11370 679 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ugt2b17P17717 530 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gria1P23818 907 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sox2P48432 319 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 QrfprP83861 433 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cry1P97784 606 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sox4Q06831 440 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rbm15Q0VBL3 962 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PrtgQ2EY15 1191 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q810N5 247 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rspry1Q8BVR6 576 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rdh12Q8BYK4 316 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem221Q8K071 230 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrpl38Q8K2M0 380 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp940Q8R2Q3 566 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ugt2b38Q91WH2 530 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Marc2Q922Q1 338 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem9Q9CR23 183 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chaf1bQ9D0N7 572 aa12.26□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A0A1L1ST33 502 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vsig10lD3YZF7 868 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdk2ap1O35207 114 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mkln1O89050 735 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 OstnP61364 130 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam105aQ3TVP5 353 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cmpk2Q3U5Q7 447 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtcap2Q5RL79 136 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc23a3Q60850 611 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pik3r3Q64143 461 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Foxb2Q64733 428 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q8BHR8 331 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Efemp1Q8BPB5 493 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lacc1Q8BZT9 430 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Casp9Q8C3Q9 454 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam110bQ8C739 366 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc5a11Q8K0E3 673 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Txndc11Q8K2W3 948 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kdelr3Q8R1L4 214 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Camk1gQ91VB2 477 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fars2Q99M01 451 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrps18bQ99N84 254 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RtcAQ9D7H3 366 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm30302A0A1Y7VN40 1110 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mterf1bB9EJ57 379 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r90E9PXJ8 863 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Maml2F6U238 1170 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RngttO55236 597 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Matn4O89029 624 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fth1P09528 182 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scg5P12961 212 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 S100a9P31725 113 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vbp1P61759 196 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NficP70255 439 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ap2m1P84091 435 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lcp2Q60787 533 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ggt1Q60928 568 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Defa-rs10Q64263 91 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klhl23Q6GQU2 558 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scn4bQ7M729 228 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prdx6bQ8BG37 224 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ChdhQ8BJ64 596 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kyat1Q8BTY1 424 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prdm8Q8BZ97 687 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr26Q8BZA7 337 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr26Q8C6G8 641 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P3h2Q8CG71 703 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem150aQ91WN2 271 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prmt3Q922H1 532 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rgs18Q99PG4 235 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9CXL3 195 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppil1Q9D0W5 166 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nos1apQ9D3A8 503 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dusp26Q9D700 211 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Habp4Q9JKS5 411 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc5a3Q9JKZ2 718 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Epb41l1Q9Z2H5 879 aa12.25□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nlrp1bA1Z198 1177 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gabrr3B2RXA8 464 aa12.24□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FanceB8JJD6 213 aa12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.7 ms