RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527644.1

TSPAN4-217, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-217ENST00000527644 PEX12O00623 359 aa25.11■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 FOXL2P58012 376 aa25.11■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 USP10Q14694 798 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa25.11■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 GRTP1Q5TC63 336 aa25.11■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 ATG14Q6ZNE5 492 aa25.11■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 PYCR2Q96C36 320 aa25.11■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa25.11■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 SPSB2Q99619 263 aa25.11■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 SLC25A23Q9BV35 468 aa25.11■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa25.11■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa25.1■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 VSTM2BA6NLU5 285 aa25.1■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 CEACAM4O75871 244 aa25.1■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 SPRP35270 261 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 GRK3P35626 688 aa25.1■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 CDKL1Q00532 357 aa25.1■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 ASB18Q6ZVZ8 466 aa25.1■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa25.1■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa25.1■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa25.1■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 ABHD11Q8NFV4 315 aa25.1■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 FBF1Q8TES7 1133 aa25.1■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 FAM129AQ9BZQ8 928 aa25.1■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 DERL2Q9GZP9 239 aa25.1■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 CAB39LQ9H9S4 337 aa25.1■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 CTSFQ9UBX1 484 aa25.1■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 ANAPC2Q9UJX6 822 aa25.1■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 OARD1Q9Y530 152 aa25.1■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 CTAGE15A4D2H0 777 aa25.09■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 J3QKU1 62 aa25.09■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 K7EM74 188 aa25.09■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.611e-6■■■■□ 20.5
TSPAN4-217ENST00000527644 ANXA5P08758 320 aa25.09■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 CTAGE8P0CG41 777 aa25.09■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 CDH1P12830 882 aa25.09■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 STMN1P16949 149 aa25.09■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 MMP11P24347 488 aa25.09■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 OCA2Q04671 838 aa25.09■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 NAB1Q13506 487 aa25.09■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 FAM53BQ14153 422 aa25.09■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 NDUFA9Q16795 377 aa25.09■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 CTAGE6Q86UF2 777 aa25.09■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 CTAGE4Q8IX94 777 aa25.09■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 PPM1NQ8N819 430 aa25.09■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 KIF18AQ8NI77 898 aa25.09■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 OR4K3Q96R72 315 aa25.09■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 MLXIPLQ9NP71 852 aa25.09■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 P4HTMQ9NXG6 502 aa25.09■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 P2RX6O15547 441 aa25.08■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 NR1D1P20393 614 aa25.08■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 FBLP22087 321 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 HNMTP50135 292 aa25.08■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 CCR8P51685 355 aa25.08■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 DSG2Q14126 1118 aa25.08■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 TSNQ15631 228 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 CEP128Q6ZU80 1094 aa25.08■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 VN1R4Q7Z5H5 301 aa25.08■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 TMEM151BQ8IW70 566 aa25.08■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 OR4K1Q8NGD4 311 aa25.08■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 STT3BQ8TCJ2 826 aa25.08■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 DRC3Q9H069 523 aa25.08■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa25.07■■□□□ 1.6
TSPAN4-217ENST00000527644 FEZF1A0PJY2 475 aa25.07■■□□□ 1.6
TSPAN4-217ENST00000527644 PGDP52209 483 aa25.07■■□□□ 1.6
TSPAN4-217ENST00000527644 KLRB1Q12918 225 aa25.07■■□□□ 1.6
TSPAN4-217ENST00000527644 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
TSPAN4-217ENST00000527644 DCAF10Q5QP82 559 aa25.07■■□□□ 1.6
TSPAN4-217ENST00000527644 FRA10AC1Q70Z53 315 aa25.07■■□□□ 1.6
TSPAN4-217ENST00000527644 MIEF2Q96C03 454 aa25.07■■□□□ 1.6
TSPAN4-217ENST00000527644 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
TSPAN4-217ENST00000527644 SEMA3GQ9NS98 782 aa25.07■■□□□ 1.6
TSPAN4-217ENST00000527644 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
TSPAN4-217ENST00000527644 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa25.07■■□□□ 1.6
TSPAN4-217ENST00000527644 PCSK5Q92824 1860 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPAN4-217ENST00000527644 AGPSO00116 658 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPAN4-217ENST00000527644 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
TSPAN4-217ENST00000527644 FOXS1O43638 330 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPAN4-217ENST00000527644 PDGFAP04085 211 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPAN4-217ENST00000527644 ZGLP1P0C6A0 271 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPAN4-217ENST00000527644 CCDC166P0CW27 439 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPAN4-217ENST00000527644 SLC26A3P40879 764 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPAN4-217ENST00000527644 BCL6P41182 706 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPAN4-217ENST00000527644 RAB10P61026 200 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPAN4-217ENST00000527644 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPAN4-217ENST00000527644 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
TSPAN4-217ENST00000527644 MFSD9Q8NBP5 474 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPAN4-217ENST00000527644 CLEC1AQ8NC01 280 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPAN4-217ENST00000527644 CAMKVQ8NCB2 501 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPAN4-217ENST00000527644 FDCSPQ8NFU4 85 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPAN4-217ENST00000527644 TM4SF19Q96DZ7 209 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPAN4-217ENST00000527644 EGFL8Q99944 293 aa25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms