RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522788.5

HOXA3-206, Transcript of homeobox A3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXA3, Length 581 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-206ENST00000522788 CCDC88CQ9P219 2028 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 TXNDC9O14530 226 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 FFAR3O14843 346 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 GPR42O15529 346 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 PIAS1O75925 651 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 STATHP02808 62 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 HIST1H2ADP20671 130 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 AP1S2P56377 157 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 TAS2R39P59534 338 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 OCA2Q04671 838 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 FAM53BQ14153 422 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 ZNF460Q14592 562 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 SBSNQ6UWP8 590 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 PRSS58Q8IYP2 241 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 OR11G2Q8NGC1 345 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 OR4K3Q96R72 315 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 HIST1H2AJQ99878 128 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 H2AFJQ9BTM1 129 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 MFRPQ9BY79 579 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 TTLL8A6PVC2 850 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 I3L1I5 382 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 CCND1P24385 295 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 SSTR1P30872 391 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 RBBP7Q16576 425 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 PPP1R3AQ16821 1122 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 ATG9BQ674R7 924 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 SLC6A19Q695T7 634 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 CAPN12Q6ZSI9 719 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 C17orf64Q86WR6 236 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 PYCR2Q96C36 320 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 FBXL8Q96CD0 374 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 TM4SF19Q96DZ7 209 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 THAP11Q96EK4 314 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 MACROD1Q9BQ69 325 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 DRC3Q9H069 523 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 SAYSD1Q9NPB0 183 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 ARL15Q9NXU5 204 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 C3orf18Q9UK00 162 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 FEZF1A0PJY2 475 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 C1QAP02745 245 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 CDH1P12830 882 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 SAT1P21673 171 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 BCL6P41182 706 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 Q0VFX4 171 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 CALCOCO2Q13137 446 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 SYT16Q17RD7 645 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 IGFL3Q6UXB1 125 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 CEP97Q8IW35 865 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 SHISA5Q8N114 240 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 ABHD11Q8NFV4 315 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 PYROXD1Q8WU10 500 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 ANKRD49Q8WVL7 239 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 PNPLA2Q96AD5 504 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 TGIF2Q9GZN2 237 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 RHOJQ9H4E5 214 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 LUZP4Q9P127 313 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 TRPC4Q9UBN4 977 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 ANKRD12Q6UB98 2062 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-206ENST00000522788 PCM1Q15154 2024 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXA3-206ENST00000522788 CDC7O00311 574 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXA3-206ENST00000522788 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.861e-10■■■■□ 23.9
HOXA3-206ENST00000522788 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
HOXA3-206ENST00000522788 GUCA1CO95843 209 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXA3-206ENST00000522788 ITGA3P26006 1051 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXA3-206ENST00000522788 EFNA3P52797 238 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXA3-206ENST00000522788 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
HOXA3-206ENST00000522788 TRADDQ15628 312 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXA3-206ENST00000522788 NDUFA9Q16795 377 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXA3-206ENST00000522788 TUBB8Q3ZCM7 444 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXA3-206ENST00000522788 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
HOXA3-206ENST00000522788 OR4K1Q8NGD4 311 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXA3-206ENST00000522788 CPT1CQ8TCG5 803 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXA3-206ENST00000522788 ANKRD7Q92527 254 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXA3-206ENST00000522788 C8orf44Q96CB5 159 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXA3-206ENST00000522788 VPS39Q96JC1 886 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXA3-206ENST00000522788 HAUS8Q9BT25 410 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXA3-206ENST00000522788 SARGQ9BW04 601 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXA3-206ENST00000522788 TRIM54Q9BYV2 358 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXA3-206ENST00000522788 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
HOXA3-206ENST00000522788 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXA3-206ENST00000522788 MYO18BQ8IUG5 2567 aa20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms