RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.8□□□□□ -0.844e-7■■■□□ 18
TRPS1-211ENST00000520276 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 LIN7BQ9HAP6 207 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 LRRC14BA6NHZ5 514 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 RGS10O43665 173 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 RAMP2O60895 175 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00032P0C843 101 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 HGFP14210 728 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 KCNC1P48547 511 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 NR2C2P49116 596 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 ATP4BP51164 291 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 CRISP3P54108 245 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 DNAJB13P59910 316 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 SH3BP2P78314 561 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 HOXC5Q00444 222 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 TDGQ13569 410 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 RPS6KA2Q15349 733 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 LEXMQ3ZCV2 418 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 FAM78AQ5JUQ0 283 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC190Q86UF4 302 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 ATPAF2Q8N5M1 289 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 FBLIM1Q8WUP2 373 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 SUSD6Q92537 303 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 SLC38A4Q969I6 547 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 IGSF5Q9NSI5 407 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 MKLN1Q9UL63 735 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 A0A096LPI6 279 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 LINC01387J3KSC0 135 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 CBX4O00257 560 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 RYKP34925 604 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 GZMKP49863 264 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 PTPN5P54829 565 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 CHRNB3Q05901 458 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 LIMS2Q7Z4I7 341 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 CDH24Q86UP0 819 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 CHPFQ8IZ52 775 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 PPM1MQ96MI6 270 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 GUCD1Q96NT3 240 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 UQCC2Q9BRT2 126 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 ZYG11BQ9C0D3 744 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 TUBB1Q9H4B7 451 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 ATP13A1Q9HD20 1204 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 CPNE7Q9UBL6 633 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 F5P12259 2224 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1B0GTL3 188 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 SNX4O95219 450 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 ADH5P11766 374 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 UGT2B10P36537 528 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 MADCAM1Q13477 382 aa9.79□□□□□ -0.84
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TRPS1-211ENST00000520276 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 CLVS2Q5SYC1 327 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 CFAP52Q8N1V2 620 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 FBXW5Q969U6 566 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 RDH12Q96NR8 316 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 C3orf18Q9UK00 162 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1W2PP18 115 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 MAN2B1O00754 1011 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 ERP29P30040 261 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 KRT20P35900 424 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 HNF4AP41235 474 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 DGKGP49619 791 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 AIF1P55008 147 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 RUNX3Q13761 415 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 DPYSL2Q16555 572 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 LY6G5CQ5SRR4 150 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
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TRPS1-211ENST00000520276 SCD5Q86SK9 330 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 SMRP1Q8NCR6 262 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 TUBGCP3Q96CW5 907 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 TBATAQ96M53 351 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 MYADMQ96S97 322 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 ITPAQ9BY32 194 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 PRO3102Q9H379 93 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 RIBC2Q9H4K1 309 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 CA14Q9ULX7 337 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 TPRKBQ9Y3C4 175 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 USP3Q9Y6I4 520 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 FAM20BO75063 409 aa9.78□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 CLDN11O75508 207 aa9.78□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 IL9P15248 144 aa9.78□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF30P17039 623 aa9.78□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 JUNDP17535 347 aa9.78□□□□□ -0.84
TRPS1-211ENST00000520276 HTR1EP28566 365 aa9.78□□□□□ -0.84
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