RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 MAGEB2O15479 319 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 HSPA12AO43301 675 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 NME2P1O60361 137 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 GPR137BO60478 399 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 ATP6AP2O75787 350 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 OR6A2O95222 327 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 IFNB1P01574 187 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 APRTP07741 180 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 CTSAP10619 480 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 CHRNB2P17787 502 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 CBLP22681 906 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 PSMB4P28070 264 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 HOXD10P28358 340 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 CHRNA3P32297 505 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 CLCNKAP51800 687 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 MTCP1P56278 107 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 CCZ1BP86790 482 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 NHLH1Q02575 133 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 ELP6Q0PNE2 266 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 CETN1Q12798 172 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 EPC2Q52LR7 807 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 EPHA10Q5JZY3 1008 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 CENPPQ6IPU0 288 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM71Q6P5X7 295 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 LRRC8BQ6P9F7 803 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 RGS9BPQ6ZS82 235 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 C1orf186Q6ZWK4 172 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 Q75L30 129 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 MON1BQ7L1V2 547 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 PTF1AQ7RTS3 328 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 SLC16A9Q7RTY1 509 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 VPS36Q86VN1 386 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 FAM219AQ8IW50 185 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 AADATQ8N5Z0 425 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 RNF148Q8N7C7 305 aa2.13□□□□□ -2.07
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PDE4D-218ENST00000509368 SLC4A11Q8NBS3 891 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 LEMD2Q8NC56 503 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 RDM1Q8NG50 284 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 OR56B1Q8NGI3 324 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 BRSK1Q8TDC3 778 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 SSMEM1Q8WWF3 244 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 ORAI1Q96D31 301 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 FAM81BQ96LP2 452 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 QRFPRQ96P65 431 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 PRRX2Q99811 253 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 TPPP3Q9BW30 176 aa2.13□□□□□ -2.07
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PDE4D-218ENST00000509368 KCNMB3Q9NPA1 279 aa2.13□□□□□ -2.07
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PDE4D-218ENST00000509368 QPCTLQ9NXS2 382 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 TMOD3Q9NYL9 352 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 TMOD2Q9NZR1 351 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
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PDE4D-218ENST00000509368 SCN4AP35499 1836 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 USP6P35125 1406 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 CGNL1Q0VF96 1302 aa2.13□□□□□ -2.07
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PDE4D-218ENST00000509368 ZNF197O14709 1029 aa2.13□□□□□ -2.07
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PDE4D-218ENST00000509368 COMPP49747 757 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
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PDE4D-218ENST00000509368 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 MIIPQ5JXC2 388 aa2.13□□□□□ -2.07
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PDE4D-218ENST00000509368 CYP4A22Q5TCH4 519 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 CYB5D1Q6P9G0 228 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 PODNL1Q6PEZ8 512 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
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