RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492338.2

TNS1-218, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 3

Gene TNS1, Length 957 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-218ENST00000492338 PARVBQ9HBI1 364 aa9.9□□□□□ -0.82
TNS1-218ENST00000492338 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa9.9□□□□□ -0.82
TNS1-218ENST00000492338 WHRNQ9P202 907 aa9.9□□□□□ -0.82
TNS1-218ENST00000492338 CDC14AQ9UNH5 594 aa9.9□□□□□ -0.82
TNS1-218ENST00000492338 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa9.9□□□□□ -0.82
TNS1-218ENST00000492338 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
TNS1-218ENST00000492338 OR2A25A4D2G3 310 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 FITM1A5D6W6 292 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 A6NL46 340 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 H0YGG7 62 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 KLF4O43474 513 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 KLHL41O60662 606 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 DNAJB5O75953 348 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 ITGAXP20702 1163 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 SAT1P21673 171 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 GABRB3P28472 473 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 GRNP28799 593 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 RPL21P46778 160 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 SLC12A2P55011 1212 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 CDKN2DP55273 166 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 OCA2Q04671 838 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 CHAF1BQ13112 559 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 FAM45BPQ6NSW5 357 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 PRMT9Q6P2P2 845 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 STRA8Q7Z7C7 330 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 ZBED8Q8IZ13 594 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 CSNK1A1LQ8N752 337 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 PPFIBP2Q8ND30 876 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 FAM45AQ8TCE6 357 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 CDKL2Q92772 493 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 FKBP10Q96AY3 582 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 VPS39Q96JC1 886 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 CABS1Q96KC9 395 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 ZNF285Q96NJ3 590 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 YIPF2Q9BWQ6 316 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 RAB17Q9H0T7 212 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 SLC6A20Q9NP91 592 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 TXNDC16Q9P2K2 825 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 PDE10AQ9Y233 779 aa9.89□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 H7BY64 318 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 RAD51CO43502 376 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 ANXA5P08758 320 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 EZRP15311 586 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 CCND1P24385 295 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 IMPA1P29218 277 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 CASRP41180 1078 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 OR1D4P47884 311 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 WDR4P57081 412 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 CAV1Q03135 178 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 RELAQ04206 551 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 C2orf54Q08AI8 447 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 NAE1Q13564 534 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 ATP1A4Q13733 1029 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 NDUFA9Q16795 377 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 CPZQ66K79 652 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 FRMPD2BQ6IN97 320 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 AGTRAPQ6RW13 159 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 RNF44Q7L0R7 432 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 MRGPREQ86SM8 312 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 SLC26A11Q86WA9 606 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 PAQR7Q86WK9 346 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 OR4N4Q8N0Y3 316 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 CLEC1AQ8NC01 280 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 ATL1Q8WXF7 558 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 NACC2Q96BF6 587 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 PRAP1Q96NZ9 151 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 BRINP2Q9C0B6 783 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 ATG10Q9H0Y0 220 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 WDR54Q9H977 334 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 ZNF304Q9HCX3 659 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 SAYSD1Q9NPB0 183 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 ENAMQ9NRM1 1142 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 TMEM184CQ9NVA4 438 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 ARL15Q9NXU5 204 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 SLC17A6Q9P2U8 582 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 CDC23Q9UJX2 597 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TNS1-218ENST00000492338 MAU2Q9Y6X3 613 aa9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms