RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF556Q9HAH1 456 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 GPR173Q9NS66 373 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 R4GN57 208 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0G2JLW4 131 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 PGRMC2O15173 223 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 SCO2O43819 266 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 AKAP3O75969 853 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 OLFM2O95897 454 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 PRSS1P07477 247 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 SERPINB6P35237 376 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 MYL7Q01449 175 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 ARL16Q0P5N6 197 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 AARDQ4LEZ3 155 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 XKR6Q5GH73 641 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 PRUNE1Q86TP1 453 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 MARVELD2Q8N4S9 558 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 EEF2KMTQ96G04 330 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 C4orf45Q96LM5 186 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 BTBD9Q96Q07 612 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 EPYCQ99645 322 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 GPRASP1Q5JY77 1395 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 ABCC9O60706 1549 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 P2RY10O00398 339 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 SLC22A2O15244 555 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 CIDEAO60543 219 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 NME6O75414 186 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 CDK2AP2O75956 126 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 F3P13726 295 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 DARSP14868 501 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 OR3A1P47881 315 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 OR3A3P47888 321 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 GCNT1Q02742 428 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 SGCBQ16585 318 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 AQP12AQ8IXF9 295 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 OR7A2PQ8NGA2 310 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 C5orf30Q96GV9 206 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 PANX3Q96QZ0 392 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 CUEDC2Q9H467 287 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 IL36AQ9UHA7 158 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 PFASO15067 1338 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 KLF11O14901 512 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 KRT33AO76009 404 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 DDHD2O94830 711 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 BAG3O95817 575 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 YES1P07947 543 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 HMOX1P09601 288 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 KRT3P12035 628 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 P4HA1P13674 534 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 KCNJ10P78508 379 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 CDR2Q01850 454 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 SLC34A1Q06495 639 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 SQLEQ14534 574 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC6Q16204 474 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF718Q3SXZ3 478 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 GPR33Q49SQ1 333 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 SLC35E4Q6ICL7 350 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 KLHL10Q6JEL2 608 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 SLC26A9Q7LBE3 791 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 PIGZQ86VD9 579 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 PIK3R3Q92569 461 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 CFAP36Q96G28 342 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 RASL10BQ96S79 203 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 OSBPL8Q9BZF1 889 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 SHARPINQ9H0F6 387 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 NAPBQ9H115 298 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 MMP28Q9H239 520 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 OR6C2Q9NZP2 312 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 MAD2L2Q9UI95 211 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 KCNAB3O43448 404 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 ZBTB14O43829 449 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 NT5C2P49902 561 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 CLDN17P56750 224 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 ABRQ12979 859 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 IFI44LQ53G44 452 aa6.91□□□□□ -1.3
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