RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486042.1

PHC3-211, Transcript of polyhomeotic homolog 3, humanhuman

TSL 3

Gene PHC3, Length 680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC3-211ENST00000486042 NPEPL1Q8NDH3 523 aa3.3□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 CNNM3Q8NE01 707 aa3.3□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa3.3□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 OR13A1Q8NGR1 328 aa3.3□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 GRK7Q8WTQ7 553 aa3.3□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 CCDC107Q8WV48 283 aa3.3□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 KCNE4Q8WWG9 221 aa3.3□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 IRGQQ8WZA9 623 aa3.3□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 CD101Q93033 1021 aa3.3□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 SGF29Q96ES7 293 aa3.3□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 ALG14Q96F25 216 aa3.3□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa3.3□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 SCRN2Q96FV2 425 aa3.3□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 TUBB2BQ9BVA1 445 aa3.3□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 HSD3B7Q9H2F3 369 aa3.3□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 FN3KQ9H479 309 aa3.3□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 EHD1Q9H4M9 534 aa3.3□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 PELI2Q9HAT8 420 aa3.3□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 CDH20Q9HBT6 801 aa3.3□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 SDF2L1Q9HCN8 221 aa3.3□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP3.3□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 ACTR3BQ9P1U1 418 aa3.3□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 SNX7Q9UNH6 387 aa3.3□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 JRKLQ9Y4A0 524 aa3.3□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 KIF7Q2M1P5 1343 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 ENO4A6NNW6 628 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 VGLL3A8MV65 326 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 SGK1O00141 431 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 RIPK2O43353 540 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 BUB3O43684 328 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 SMPD2O60906 423 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 KERAO60938 352 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 FAM58BPP0C7Q3 252 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 SAGP10523 405 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 TOP1P11387 765 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 ADRA2CP18825 462 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 NR1D1P20393 614 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 MSH3P20585 1137 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 PTGER4P35408 488 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 ATP5OP48047 213 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 HNMTP50135 292 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 NAGLUP54802 743 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 SARNPP82979 210 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 MECOMQ03112 1051 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 TRDNQ13061 729 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 INAQ16352 499 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 CA9Q16790 459 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 ELFN2Q5R3F8 820 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 SPATA46Q5T0L3 261 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 SFMBT2Q5VUG0 894 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 FAM91A1Q658Y4 838 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 C11orf63Q6NUN7 778 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 SPATA21Q7Z572 469 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 NUDT13Q86X67 352 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 FAM219AQ8IW50 185 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 C10orf53Q8N6V4 93 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 MAB21L3Q8N8X9 362 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 KBTBD3Q8NAB2 608 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 OR2T12Q8NG77 320 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 OR8K3Q8NH51 312 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 OCC1Q8TAD7 63 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 ATP6V0A1Q93050 837 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 MR1Q95460 341 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 LRRC45Q96CN5 670 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 TUBGCP3Q96CW5 907 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 C19orf60Q96EN9 201 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 ERO1AQ96HE7 468 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 ZNF583Q96ND8 569 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 FNBP1Q96RU3 617 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 MYADMQ96S97 322 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 INTS14Q96SY0 518 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 GAL3ST1Q99999 423 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 ACAT2Q9BWD1 397 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 FUT8Q9BYC5 575 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 ACPTQ9BZG2 426 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 FANCEQ9HB96 536 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 PARVGQ9HBI0 331 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 CRLF2Q9HC73 371 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 MED4Q9NPJ6 270 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 POLE3Q9NRF9 147 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 GLRX2Q9NS18 164 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 GKN1Q9NS71 199 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 GDAP2Q9NXN4 497 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 DONSONQ9NYP3 566 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-211ENST00000486042 DNAJB9Q9UBS3 223 aa3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms