RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423327.2

SPC24-201, Transcript of SPC24, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SPC24, Length 840 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24-201ENST00000423327 TAS2R39P59534 338 aa14.71□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 GPX6P59796 221 aa14.71□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 DSG2Q14126 1118 aa14.71□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 SYT16Q17RD7 645 aa14.71□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 LCTLQ6UWM7 567 aa14.71□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 ZDHHC24Q6UX98 284 aa14.71□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 LAPTM4BQ86VI4 370 aa14.71□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 SLC26A11Q86WA9 606 aa14.71□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 OR56A3Q8NH54 315 aa14.71□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 ANKRD49Q8WVL7 239 aa14.71□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 COL26A1Q96A83 441 aa14.71□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa14.71□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 MACROD1Q9BQ69 325 aa14.71□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 SAYSD1Q9NPB0 183 aa14.71□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 TMEM184CQ9NVA4 438 aa14.71□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 LUZP4Q9P127 313 aa14.71□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 CDC23Q9UJX2 597 aa14.71□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa14.71□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 PTPN13Q12923 2485 aa14.71□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 SCN3AQ9NY46 2000 aa14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 I3L1I5 382 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 CDC7O00311 574 aa14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 PEX12O00623 359 aa14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 SAT1P21673 171 aa14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 SLC26A3P40879 764 aa14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 SOX8P57073 446 aa14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 Q0VFX4 171 aa14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 MYBPC3Q14896 1274 aa14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 GARNL3Q5VVW2 1013 aa14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 SLC6A19Q695T7 634 aa14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 C17orf64Q86WR6 236 aa14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 AMER2Q8N7J2 671 aa14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 CLEC1AQ8NC01 280 aa14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 BBOF1Q8ND07 529 aa14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 OR11G2Q8NGC1 345 aa14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 NACC2Q96BF6 587 aa14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 FBXL8Q96CD0 374 aa14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 TM4SF19Q96DZ7 209 aa14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 MVB12AQ96EY5 273 aa14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 VPS39Q96JC1 886 aa14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 CRB3Q9BUF7 120 aa14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 MFRPQ9BY79 579 aa14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 SPNS1Q9H2V7 528 aa14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 RHOJQ9H4E5 214 aa14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 SEMA3GQ9NS98 782 aa14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 ARL15Q9NXU5 204 aa14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa14.69□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa14.69□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 CTAGE15A4D2H0 777 aa14.69□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 GUCA1CO95843 209 aa14.69□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 AP1S2P56377 157 aa14.69□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 CALCOCO2Q13137 446 aa14.69□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 RBBP7Q16576 425 aa14.69□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 MAATS1Q7Z4T9 603 aa14.69□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 CTAGE6Q86UF2 777 aa14.69□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 PALM2Q8IXS6 379 aa14.69□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 ABHD11Q8NFV4 315 aa14.69□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 FBXO25Q8TCJ0 367 aa14.69□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 PYROXD1Q8WU10 500 aa14.69□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 MIEF2Q96C03 454 aa14.69□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 C8orf44Q96CB5 159 aa14.69□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 DRC3Q9H069 523 aa14.69□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 PCBD2Q9H0N5 130 aa14.69□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 CAB39LQ9H9S4 337 aa14.69□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 C3orf18Q9UK00 162 aa14.69□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa14.69□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa14.69□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 FAM159BA6NKW6 160 aa14.68□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 NDC80O14777 642 aa14.68□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 DPM1O60762 260 aa14.68□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 IGHEP01854 428 aa14.68□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 IL1RNP18510 177 aa14.68□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 CCND1P24385 295 aa14.68□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 HRH2P25021 359 aa14.68□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 OCA2Q04671 838 aa14.68□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.061e-7■■■□□ 16.7
SPC24-201ENST00000423327 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SPC24-201ENST00000423327 FAM53BQ14153 422 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms