RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 ZNF542PQ5EBM4 170 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 HID1Q8IV36 788 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 MINDY2Q8NBR6 621 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 CCDC138Q96M89 665 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 TMEM168Q9H0V1 697 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 KLF15Q9UIH9 416 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 NOL3O60936 208 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 CYP2A7P20853 494 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 AK4P27144 223 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 GDF5P43026 501 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 HSPA7P48741 367 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 CLCNKAP51800 687 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 RPA4Q13156 261 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 MTX3Q5HYI7 312 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 OGFOD2Q6N063 350 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 SLC36A4Q6YBV0 504 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 PDZD3Q86UT5 571 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 SLCO4A1Q96BD0 722 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 RIC8BQ9NVN3 520 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 ARMC1Q9NVT9 282 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 PCTPQ9UKL6 214 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 A0A1B0GTL3 188 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 TNFRSF10CO14798 259 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 C1orf105O95561 183 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 S100BP04271 92 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 CD1EP15812 388 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 FZD2Q14332 565 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 C1orf210Q8IVY1 113 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 RNF148Q8N7C7 305 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 C1orf216Q8TAB5 229 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 MCOLN3Q8TDD5 553 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 SNX13Q9Y5W8 968 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 A0A1W2PR77 199 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 NELFEP18615 380 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 NR1D2Q14995 579 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 CHSY3Q70JA7 882 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 ZNF786Q8N393 782 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 STARD8Q92502 1023 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 KLHDC7BQ96G42 594 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 FOPNLQ96NB1 174 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 PSD2Q9BQI7 771 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 A0A1W2PPW3 197 aa23.59■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 E2F3O00716 465 aa23.59■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 TOR1BO14657 336 aa23.59■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 RASGRP1O95267 797 aa23.59■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 STAMBPO95630 424 aa23.59■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 HIST1H2ADP20671 130 aa23.59■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 TMBIM6P55061 237 aa23.59■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 STX5Q13190 355 aa23.59■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 MAPRE2Q15555 327 aa23.59■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 HMBOX1Q6NT76 420 aa23.59■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa23.59■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 HIST1H2AJQ99878 128 aa23.59■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 H2AFJQ9BTM1 129 aa23.59■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 TRIM54Q9BYV2 358 aa23.59■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 TM9SF3Q9HD45 589 aa23.59■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 WWOXQ9NZC7 414 aa23.59■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 ADA2Q9NZK5 511 aa23.59■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 CROTQ9UKG9 612 aa23.59■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa23.58■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 TMEM233B4DJY2 109 aa23.58■■□□□ 1.37
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CTU1-201ENST00000421832 ANXA5P08758 320 aa23.58■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 ATP1A4Q13733 1029 aa23.58■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 RAB39AQ14964 217 aa23.58■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 ANKS6Q68DC2 871 aa23.58■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 SULT1C3Q6IMI6 304 aa23.58■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 OR5AR1Q8NGP9 310 aa23.58■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 NRTNQ99748 197 aa23.58■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 CIB1Q99828 191 aa23.58■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 PRDM8Q9NQV8 689 aa23.58■■□□□ 1.37
CTU1-201ENST00000421832 EML2O95834 649 aa23.58■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 CD38P28907 300 aa23.58■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 CLCQ05315 142 aa23.58■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP23.58■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 SLC2A7Q6PXP3 512 aa23.58■■□□□ 1.36
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