RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 AKAP14Q86UN6 197 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 MEIOBQ8N635 442 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 NFKBIDQ8NI38 313 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 TRPV5Q9NQA5 729 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 PLAGL1Q9UM63 463 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 DIO3P55073 304 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 CYS1Q717R9 158 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 RANBP9Q96S59 729 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 NPPAP01160 153 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 ETV3P41162 512 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 DNASE1L1P49184 302 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 ERMP1Q7Z2K6 904 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 NUP54Q7Z3B4 507 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 RHEBL1Q8TAI7 183 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 PYURFQ96I23 114 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 PHF12Q96QT6 1004 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 DAPL1A0PJW8 107 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 IFNA6P05013 189 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 HMGN1P05114 100 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP20.78■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 UBAP1Q9NZ09 502 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 POFUT2Q9Y2G5 429 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 MYH11P35749 1972 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC35E2BP0CK96 405 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 RAB25P57735 213 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 PPP1R3AQ16821 1122 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 ELOA3BQ3SY89 546 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 ELOA3Q8NG57 546 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 HPS1Q92902 700 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 BACE2Q9Y5Z0 518 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 LDB2O43679 373 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 SCN1BQ07699 218 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 CLIP4Q8N3C7 705 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM130Q8N3G9 435 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 NPTX1Q15818 432 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 NPWQ8N729 165 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 IL4I1Q96RQ9 567 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 MKS1Q9NXB0 559 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 RAB43Q86YS6 212 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 OR6K6Q8NGW6 343 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 ADH1BP00325 375 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 TIGD6Q17RP2 521 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 DGAT2Q96PD7 388 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 MYH6P13533 1939 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF823P16415 610 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 TREML1Q86YW5 311 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 MED31Q9Y3C7 131 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRJ-201ENST00000418331 SDHDO14521 159 aa20.77■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 GSRP00390 522 aa20.77■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 RGPD1P0DJD0 1748 aa20.77■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 FPR1P21462 350 aa20.77■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 CEP97Q8IW35 865 aa20.77■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 GLYATL1Q969I3 302 aa20.77■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 LRIG1Q96JA1 1093 aa20.77■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 HSH2DQ96JZ2 352 aa20.77■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa20.77■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 HCN3Q9P1Z3 774 aa20.77■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 EFCAB9A8MZ26 197 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 CYBAP13498 195 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 GSTM3P21266 225 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNA5P22460 613 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 IVDP26440 423 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 ECHS1P30084 290 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 TP53INP2Q8IXH6 220 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 AVL9Q8NBF6 648 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 STON2Q8WXE9 905 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 COMMD4Q9H0A8 199 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 ERVK-11Q9UQG0 969 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 A8MUA0 341 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 TEX28O15482 410 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 CD36P16671 472 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF763Q0D2J5 394 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 CBX3Q13185 183 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 SPATS1Q496A3 300 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 STEAP4Q687X5 459 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 HERPUD2Q9BSE4 406 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 DSN1Q9H410 356 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 TAS2R7Q9NYW3 318 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 TLR4O00206 839 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 TSPAN6O43657 245 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRJ-201ENST00000418331 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms