RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 CDH11P55287 796 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 MFSD10Q14728 455 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 NTRK2Q16620 822 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 CYBRD1Q53TN4 286 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 ATAT1Q5SQI0 421 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 BCL2L15Q5TBC7 163 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 RAET1GQ6H3X3 334 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 LCN8Q6JVE9 175 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 IQCHQ86VS3 1027 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 TICAM1Q8IUC6 712 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 SPARTQ8N0X7 666 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 MINDY1Q8N5J2 469 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 NEIL3Q8TAT5 605 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 COQ10AQ96MF6 247 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 PEBP4Q96S96 227 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 GPR88Q9GZN0 384 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 COPZ2Q9P299 210 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 RIMS3Q9UJD0 308 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 FBXW11Q9UKB1 542 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 NFAT5O94916 1531 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 PSMD9O00233 223 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 QSOX1O00391 747 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 PRMT3O60678 531 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 SCN2BO60939 215 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 RAB36O95755 333 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 DHRS4L1P0CG22 281 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 CELP19835 753 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 HTR2AP28223 471 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 ETV4P43268 484 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 OR1E2P47887 323 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 SMSP52788 366 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 ENPP6Q6UWR7 440 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 C17orf64Q86WR6 236 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 OR2L3Q8NG85 312 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 NFKBIDQ8NI38 313 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 FRS2Q8WU20 508 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 NCSTNQ92542 709 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 PYCR2Q96C36 320 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 HSPA12BQ96MM6 686 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 TRIM36Q9NQ86 728 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 GPR83Q9NYM4 423 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 MEIOCA2RUB1 952 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 HLA-DQB2P05538 268 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 ARL2P36404 184 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 CASP3P42574 277 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 BTN1A1Q13410 526 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 DGKZQ13574 1117 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 PTGR1Q14914 329 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 ATAD3CQ5T2N8 411 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 ARSKQ6UWY0 536 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 PAMR1Q6UXH9 720 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 CERS5Q8N5B7 392 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 OR6K6Q8NGW6 343 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 AKT1S1Q96B36 256 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 COMMD4Q9H0A8 199 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 MFSD1Q9H3U5 465 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 MEAF6Q9HAF1 191 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 MEMO1Q9Y316 297 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 B8ZZF3 427 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 C9IYK1 514 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 J3QLW9 94 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 SAP18O00422 153 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 ZNF19P17023 458 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 GPR1P46091 355 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 EMX2Q04743 252 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 SNTA1Q13424 505 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 LINGO4Q6UY18 593 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 AGMOQ6ZNB7 445 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 GALNT7Q86SF2 657 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 ATCAYQ86WG3 371 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 CERKQ8TCT0 537 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 TWNKQ96RR1 684 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 LGR4Q9BXB1 951 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 PPA2Q9H2U2 334 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 TRPV2Q9Y5S1 764 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa9.52□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 ANKRD34BA5PLL1 514 aa9.52□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 MCIDASD6RGH6 385 aa9.52□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 F5H0A9 414 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 PCDH17O14917 1159 aa9.52□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 RAB3BP20337 219 aa9.52□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms