RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384671.1

RNU6-959P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 959, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-959P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-959P-201ENST00000384671 NDST1P52848 882 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 CXCL6P80162 114 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 TRIM29Q14134 588 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 POSTNQ15063 836 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 CCDC38Q502W7 563 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 ELFN2Q5R3F8 820 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 TMEM198Q66K66 360 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 FCRLAQ7L513 359 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 FAM89BQ8N5H3 189 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 CCDC107Q8WV48 283 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 DNAI2Q9GZS0 605 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 TRPV4Q9HBA0 871 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 KLRF1Q9NZS2 232 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 SPATA2Q9UM82 520 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 CAMK2AQ9UQM7 478 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 A0A1W2PRG0 241 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 FRMD3A2A2Y4 597 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 DLGAP1O14490 977 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 GH2P01242 217 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 JAK1P23458 1154 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 ABCD1P33897 745 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 BRCC3P46736 316 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 TRPC1P48995 793 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 FNTAP49354 379 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 EIF5P55010 431 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 CRMP1Q14194 572 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 MELKQ14680 651 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 TGIF1Q15583 401 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 POM121L1PQ3SYA9 428 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 IL31Q6EBC2 164 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 PRDM4Q9UKN5 801 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 TRIM17Q9Y577 477 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 A0A1W2PPK0 400 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 CCT8L1PA6NM43 557 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 E2F3O00716 465 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 OGG1O15527 345 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 UFL1O94874 794 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 ZNF286BP0CG31 522 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 FUT3P21217 361 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 AADACP22760 399 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 GPR183P32249 361 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 NEK3P51956 506 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 ZNF136P52737 540 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 LMOD3Q0VAK6 560 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 SLC25A34Q6PIV7 304 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 ZBTB10Q96DT7 871 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 OR6C1Q96RD1 312 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 CCT8L2Q96SF2 557 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 CCDC3Q9BQI4 270 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 FUZQ9BT04 418 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 CRB3Q9BUF7 120 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 ZBP1Q9H171 429 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 NLRC4Q9NPP4 1024 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 KLK11Q9UBX7 282 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 ZNF835Q9Y2P0 537 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-959P-201ENST00000384671 FBN2P35556 2912 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-959P-201ENST00000384671 A8MX80 341 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-959P-201ENST00000384671 LRRTM2O43300 516 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-959P-201ENST00000384671 SSX4O60224 188 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-959P-201ENST00000384671 PAGE4O60829 102 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-959P-201ENST00000384671 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-959P-201ENST00000384671 ATP1B1P05026 303 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-959P-201ENST00000384671 CD1DP15813 335 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-959P-201ENST00000384671 SPRP35270 261 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-959P-201ENST00000384671 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-959P-201ENST00000384671 ADARP55265 1226 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-959P-201ENST00000384671 TFAP4Q01664 338 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-959P-201ENST00000384671 PAX5Q02548 391 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-959P-201ENST00000384671 OVGP1Q12889 678 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-959P-201ENST00000384671 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-959P-201ENST00000384671 TMEM266Q2M3C6 531 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-959P-201ENST00000384671 CDC73Q6P1J9 531 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-959P-201ENST00000384671 RFWD3Q6PCD5 774 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-959P-201ENST00000384671 ZFP2Q6ZN57 461 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-959P-201ENST00000384671 BBS12Q6ZW61 710 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-959P-201ENST00000384671 MCM10Q7L590 875 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-959P-201ENST00000384671 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-959P-201ENST00000384671 NUDT13Q86X67 352 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-959P-201ENST00000384671 CEP57L1Q8IYX8 460 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-959P-201ENST00000384671 SLC22A15Q8IZD6 547 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-959P-201ENST00000384671 SPICE1Q8N0Z3 855 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-959P-201ENST00000384671 OR9Q2Q8NGE9 314 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-959P-201ENST00000384671 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-959P-201ENST00000384671 VSIG2Q96IQ7 327 aa-0.04□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms