RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm14781A2A9Q9 366 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rdh8D3Z6W3 317 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8879F6R3J9 157 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r25H3BLP0 302 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sp1O89090 784 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 P01664 111 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TP20293 436 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kcnj9P48543 393 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Btbd3P58545 530 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mageb5Q14AN0 366 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pdss2Q33DR3 401 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tapt1Q4VBD2 564 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cep44Q5HZK1 386 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Il18r1Q61098 537 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 HadhQ61425 314 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ubtd2Q6PGH0 234 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1015Q7TR94 312 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr538Q7TRT5 310 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rmnd5aQ80YQ8 391 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 BpifcQ8C186 509 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Abhd18Q8C1A9 464 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc35b4Q8CIA5 331 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 EsamQ925F2 394 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cadm3Q99N28 396 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 2310003L06RikQ9CV82 495 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zswim7Q9CWQ2 152 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q9D937 123 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Upk1bQ9Z2C6 260 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prrg1A2BFE8 218 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm10324L7N208 604 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tead2P48301 445 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gjb5Q02739 271 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Chsy3Q5DTK1 884 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tnpo3Q6P2B1 923 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Snx6Q6P8X1 406 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1355Q7TQU9 310 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rbbp8Q80YR6 893 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arhgap19Q8BRH3 494 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Angptl7Q8R1Q3 337 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 St3gal4Q91Y74 333 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lrrc49Q91YK0 686 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Skp2Q9Z0Z3 424 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1375A0A0N4SUP0 313 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Foxd2O35392 492 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cd93O89103 644 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SrgnP13609 152 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ptger4P32240 513 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bpifa6Q0VGU8 367 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Esrp1Q3US41 680 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prkd1Q62101 918 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MyorgQ69ZQ1 716 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Itln1bQ80ZA0 313 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gjc2Q8BQU6 440 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Phtf2Q8CB19 747 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zc2hc1cQ8CCG1 527 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 P3h2Q8CG71 703 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r214Q8R279 367 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NclnQ8VCM8 563 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GabarapQ9DCD6 117 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Il1rl2Q9ERS7 574 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Krt28A6BLY7 462 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Clk4O35493 481 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Matn4O89029 624 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TecP24604 630 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 HmgclP38060 325 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rps14P62264 151 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rps3P62908 243 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MthfsdQ3URQ7 372 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm2aQ60648 193 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sf1Q64213 653 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 LsampQ8BLK3 341 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Palm2Q8BR92 376 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppp1r3eQ8BRJ4 279 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bend7Q8BSV3 434 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Acad9Q8JZN5 625 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr791Q8VGJ0 312 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pdzd3Q99MJ6 498 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tcam1Q99NB3 548 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Uqcc2Q9CQY6 136 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NtsQ9D3P9 169 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Uba7Q9DBK7 977 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nufip1Q9QXX8 484 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Khdrbs3Q9R226 346 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lama2Q60675 3118 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fbxo47A2A6H3 451 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 4930402K13RikB1AW18 415 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 P01636 108 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PfklP12382 780 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Apoa1Q00623 264 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cab39Q06138 341 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q3U7U4 132 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Foxk2Q3UCQ1 651 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 BC061212Q6P8K3 481 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc2a12Q8BFW9 622 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dnajc27Q8CFP6 273 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Glcci1Q8K3I9 537 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ranbp3Q9CT10 491 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Asb4Q9WV71 426 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tcf7l1Q9Z1J1 584 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm16506F7ANP4 213 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.5 ms