RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020258.9

Herc4-201, Transcript of Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc4, Length 3,898 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4-201ENSMUST00000020258 Nrif1Q923B3 828 aa11.14□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Spesp1Q9D5A0 399 aa11.14□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc39a5Q9D856 535 aa11.14□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fezf2Q9ESP5 455 aa11.14□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Smarcb1Q9Z0H3 385 aa11.14□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cst9Q9Z0H6 137 aa11.14□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Igkv10-96A0A140T8M1 115 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 A0A1L1ST33 502 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mgat4eA6H684 439 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr171G5E8J1 314 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm10324L7N208 604 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 GzmcP08882 248 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 MndaP0DOV1 425 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pmp22P16646 161 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Emx1Q04742 257 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Dcaf13Q6PAC3 445 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1197Q7TR13 314 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1196Q7TR14 314 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1015Q7TR94 312 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Spata7Q80VP2 582 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 C2cd4bQ80XU5 340 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rcor1Q8CFE3 480 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Vmn1r198Q8R263 300 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Prmt3Q922H1 532 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Dhrs1Q99L04 313 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Vmn1r29Q9EQ41 303 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Asb4Q9WV71 426 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc32a1O35633 525 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 P01636 108 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Alox12P39655 663 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 DckP43346 260 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 SctrQ5FWI2 447 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Zscan26Q5RJ54 466 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ckap4Q8BMK4 575 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tusc3Q8BTV1 347 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Akr1d1Q8VCX1 325 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Lims2Q91XD2 341 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 BollQ924M5 281 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Nudt17Q9CWD3 296 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 CutalQ9D1U5 156 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ehd1Q9WVK4 534 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Izumo4D3Z690 227 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm6356L7N2A7 188 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ptch2O35595 1182 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gp1baO35930 734 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 P01668 110 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc7a2P18581 657 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mkl2P59759 1080 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1051Q7TR76 308 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Vmn2r81Q80Z09 865 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 PgghgQ8BP56 690 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fmo2Q8K2I3 535 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Irak4Q8R4K2 459 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Adgrl4Q923X1 739 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 D10Jhu81eQ9D172 266 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Zswim2Q9D9X6 631 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Khdrbs3Q9R226 346 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Upk1bQ9Z2C6 260 aa11.13□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Spin2-ps6A0A140T8V2 174 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1040A2ARY1 313 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm17555F6U8B9 371 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm16506F7ANP4 213 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ech1O35459 327 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Dpf3P58269 378 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rps3P62908 243 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 IgfalsP70389 603 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fam105aQ3TVP5 353 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 GcgrQ61606 485 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Guf1Q8C3X4 651 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Phtf2Q8CB19 747 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Smco1Q8CEZ1 214 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Zbtb20Q8K0L9 741 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Igsf8Q8R366 611 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ppp1r14cQ8R4S0 164 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pbld1Q9DCG6 288 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Snap29Q9ERB0 260 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 TrehQ9JLT2 576 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 FarsbQ9WUA2 589 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ly75Q60767 1723 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Auts2A0A087WPF7 1261 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 AccsA2AIG8 502 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 4930402K13RikB1AW18 415 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 H60cB1B213 197 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Kif28pD3YXS5 1028 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Vmn2r116E9Q6I0 856 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm28048F7BCN0 99 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Hps1O08983 704 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tssk2O54863 358 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tk1P04184 233 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pcmt1P23506 227 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 VldlrP98156 873 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Yy2Q3TTC2 378 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc29a2Q61672 456 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pkp4Q68FH0 1190 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Txndc15Q6P6J9 344 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 PapolgQ6PCL9 739 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1288Q7TQY0 312 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Npas4Q8BGD7 802 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc45a1Q8BIV7 751 aa11.12□□□□□ -0.63
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ugt2b35Q8BJL9 529 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 69.4 ms