RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 PHF2O75151 1096 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 RASAL1O95294 804 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP5DP30049 168 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF425Q6IV72 752 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 CES3Q6UWW8 571 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM207Q6UWW9 146 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 MFSD3Q96ES6 412 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 IL22Q9GZX6 179 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF32Q9H0A6 362 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 TAC3Q9UHF0 121 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 FBN2P35556 2912 aa24.33■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA8KD6RF30 607 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA8TH3BQL2 631 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 CCL21O00585 134 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 P2RX6O15547 441 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 VAPBO95292 243 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 ANXA5P08758 320 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 TYSND1Q2T9J0 566 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 ACSBG2Q5FVE4 666 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 GARNL3Q5VVW2 1013 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM205Q6UW68 189 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 MRGPRGQ86SM5 289 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 RUBCNLQ9H714 662 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 SEC14L3Q9UDX4 400 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 OTOGQ6ZRI0 2925 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5H15A6NDH6 313 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 WISP2O76076 250 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 CRYABP02511 175 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 CA7P43166 264 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 PMP22Q01453 160 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 ICE2Q659A1 982 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 NEK10Q6ZWH5 1172 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 PPFIBP2Q8ND30 876 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 IMMP1LQ96LU5 166 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 PKP4Q99569 1192 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 DRC3Q9H069 523 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 SYBUQ9NX95 663 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 PCYOX1Q9UHG3 505 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 MKL2Q9ULH7 1088 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 CRYL1Q9Y2S2 319 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 APCP25054 2843 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 PRAMEF2O60811 474 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 EZRP15311 586 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 MGAT1P26572 445 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 BASP1P80723 227 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF33BQ06732 778 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGAP19Q14CB8 494 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL38Q2WGJ6 581 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 ABHD17BQ5VST6 288 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 MRNIPQ6NTE8 343 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 SPNS2Q8IVW8 549 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 SHISA5Q8N114 240 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJB8Q8NHS0 232 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 KIFC1Q9BW19 673 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 BFARQ9NZS9 450 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 ESR1P03372 595 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 CHRM3P20309 590 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 HTR1EP28566 365 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 NPY2RP49146 381 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 PNLIPRP1P54315 467 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNJ11Q14654 390 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 PLD3Q8IV08 490 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 SUN3Q8TAQ9 357 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 TUBB6Q9BUF5 446 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM114A2Q9NRY5 505 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 CSMD2Q7Z408 3487 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 H3BMM5 538 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 HAT1O14929 419 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 CCNDBP1O95273 360 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC16A8O95907 504 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 STATHP02808 62 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 C8orf89P0DMQ9 161 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 ICAM2P13598 275 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 PKMP14618 531 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 ADARP55265 1226 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF480Q8WV37 535 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 VN1R1Q9GZP7 353 aa24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms