RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-229	ENST00000551936	CABS1	Q96KC9	395 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CS-229	ENST00000551936	AGAP4	Q96P64	663 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CS-229	ENST00000551936	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CS-229	ENST00000551936	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CS-229	ENST00000551936	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CS-229	ENST00000551936	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CS-229	ENST00000551936	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CS-229	ENST00000551936	SMAP	O00193	183 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	HAT1	O14929	419 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	HP	P00738	406 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	GABRB3	P28472	473 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	NR6A1	Q15406	480 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	HIF1A	Q16665	826 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	AMER3	Q8N944	861 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	C8orf44	Q96CB5	159 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	C3orf18	Q9UK00	162 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	SNX12	Q9UMY4	172 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936		H7BY64	318 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	TXNDC9	O14530	226 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	FFAR3	O14843	346 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	GPR42	O15529	346 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	P2RX6	O15547	441 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	ZSCAN12	O43309	604 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	BANF1	O75531	89 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	KLHL18	O94889	574 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	RNF224	P0DH78	156 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	ACPP	P15309	386 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	PGAM1	P18669	254 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	EMP2	P54851	167 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	PTK6	Q13882	451 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	DSG2	Q14126	1118 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	CRYM	Q14894	314 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	PPP1R7	Q15435	360 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	MSS51	Q4VC12	460 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	PLD3	Q8IV08	490 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	PRR7	Q8TB68	274 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	IDS	B3KWA1	339 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	MAP2K7	O14733	419 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	13.75	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	AHSG	P02765	367 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	COX6A1	P12074	109 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	IVD	P26440	423 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	FAM53B	Q14153	422 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	SYT16	Q17RD7	645 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	ADCK2	Q7Z695	626 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	PCGF5	Q86SE9	256 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	PSMF1	Q92530	271 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	SLCO2A1	Q92959	643 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	CCDC138	Q96M89	665 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	LMF1	Q96S06	567 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	NDN	Q99608	321 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	PDE10A	Q9Y233	779 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936		A0A1W2PQ72	361 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	TTC4	O95801	387 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-229	ENST00000551936	HEXB	P07686	556 aa		13.74	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms