RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504440.1

NPHP3-AS1-202, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,507 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ARHGEF15O94989 841 aa6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ATF6P18850 670 aa6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FMO3P31513 532 aa6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TTPAP49638 278 aa6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NEK2P51955 445 aa6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RAD23AP54725 363 aa6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMBIM6P55061 237 aa6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GP2P55259 537 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ARF5P84085 180 aa6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PPP2R2BQ00005 443 aa6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IL1RL1Q01638 556 aa6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RTP2Q5QGT7 225 aa6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CRTC3Q6UUV7 619 aa6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RNF175Q8N4F7 328 aa6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ABHD11Q8NFV4 315 aa6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC13A3Q8WWT9 602 aa6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NEURL2Q9BR09 285 aa6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MAGEH1Q9H213 219 aa6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 P2RY12Q9H244 342 aa6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C1GALT1Q9NS00 363 aa6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PSME2Q9UL46 239 aa6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RIMKLBQ9ULI2 386 aa6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PDE10AQ9Y233 779 aa6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SH3GLB1Q9Y371 365 aa6.4□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 VWA8A3KMH1 1905 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LOC730098B7Z3J9 87 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NOL3O60936 208 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SEC22BO75396 215 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SULT1C4O75897 302 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CLPXO76031 633 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LRATO95237 230 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PRAMEF1O95521 474 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SERPINA1P01009 418 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FTH1P02794 183 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RHOCP08134 193 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GSTM2P28161 218 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EPHA2P29317 976 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NOS3P29474 1203 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HOXC12P31275 282 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TTKP33981 857 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CDKN2CP42773 168 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ISL1P61371 349 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IFITM3Q01628 133 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MAP4K2Q12851 820 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC14A1Q13336 389 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MAPKAPK3Q16644 382 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SPATS1Q496A3 300 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CARD16Q5EG05 197 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DET1Q7L5Y6 550 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KCNJ9Q92806 393 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NCLNQ969V3 563 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 Q96M66 194 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CCDC138Q96M89 665 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM210AQ96ND0 272 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EGFL8Q99944 293 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TUBA1CQ9BQE3 449 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TM6SF2Q9BZW4 377 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NACA2Q9H009 215 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RNF38Q9H0F5 515 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ERVK-18Q9QC07 812 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DHRS7Q9Y394 339 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ANKRD36A6QL64 1941 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SHISA3A0PJX4 238 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ELOVL7A1L3X0 281 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC38A8A6NNN8 435 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ALG1L2C9J202 215 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 COCHO43405 550 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TBC1D4O60343 1298 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TULP3O75386 442 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GMNNO75496 209 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CREG1O75629 220 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CBX7O95931 251 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PCMT1P22061 227 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TACR1P25103 407 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CD6P30203 668 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DCTP40126 519 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CD97P48960 835 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BCAP31P51572 246 aa6.39□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RAPSNQ13702 412 aa6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms