RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446745.2

LTB-211, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 853 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-211ENST00000446745 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 MAU2Q9Y6X3 613 aa20.09■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 NBASA2RRP1 2371 aa20.08■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa20.08■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 TTLL8A6PVC2 850 aa20.08■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 NRP2O60462 931 aa20.08■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 ANXA5P08758 320 aa20.08■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 RPL21P46778 160 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 AP1S2P56377 157 aa20.08■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 TBPL1P62380 186 aa20.08■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 MYBPC3Q14896 1274 aa20.08■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 RBBP7Q16576 425 aa20.08■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 NDUFA9Q16795 377 aa20.08■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 HECTD2Q5U5R9 776 aa20.08■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 EFCAB3Q8N7B9 438 aa20.08■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 FBXO36Q8NEA4 188 aa20.08■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 ATL1Q8WXF7 558 aa20.08■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 TM9SF4Q92544 642 aa20.08■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 MIEF2Q96C03 454 aa20.08■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 OR2A5Q96R48 311 aa20.08■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 SPSB2Q99619 263 aa20.08■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 CRB3Q9BUF7 120 aa20.08■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 CTSFQ9UBX1 484 aa20.08■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa20.08■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 PDE10AQ9Y233 779 aa20.08■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 SNX24Q9Y343 169 aa20.08■□□□□ 0.81
LTB-211ENST00000446745 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 NUP210LQ5VU65 1888 aa20.07■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 FDXRP22570 491 aa20.07■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 GRK3P35626 688 aa20.07■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 AGTRAPQ6RW13 159 aa20.07■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 SLC26A11Q86WA9 606 aa20.07■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 C17orf64Q86WR6 236 aa20.07■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 THAP11Q96EK4 314 aa20.07■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 C10orf90Q96M02 699 aa20.07■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 HAUS8Q9BT25 410 aa20.07■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 YIPF2Q9BWQ6 316 aa20.07■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 FAM129AQ9BZQ8 928 aa20.07■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 ARL15Q9NXU5 204 aa20.07■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 FBXL4Q9UKA2 621 aa20.07■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 VSTM2BA6NLU5 285 aa20.06■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 E7ESA3 106 aa20.06■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 H7BY64 318 aa20.06■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 HAT1O14929 419 aa20.06■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 VARSP26640 1264 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 SOX8P57073 446 aa20.06■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 RAPSNQ13702 412 aa20.06■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 DSG2Q14126 1118 aa20.06■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 ZBED8Q8IZ13 594 aa20.06■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.06■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 STT3BQ8TCJ2 826 aa20.06■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 PYROXD1Q8WU10 500 aa20.06■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 VPS39Q96JC1 886 aa20.06■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 PRAP1Q96NZ9 151 aa20.06■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 ERP44Q9BS26 406 aa20.06■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 DRC3Q9H069 523 aa20.06■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 PLAC1Q9HBJ0 212 aa20.06■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 SLAMF7Q9NQ25 335 aa20.06■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 C14orf105Q9NVL8 296 aa20.06■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 WHRNQ9P202 907 aa20.06■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 SLC17A6Q9P2U8 582 aa20.06■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 ZGLP1P0C6A0 271 aa20.05■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 ITGA3P26006 1051 aa20.05■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 ETF1P62495 437 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 NAE1Q13564 534 aa20.05■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 HKDC1Q2TB90 917 aa20.05■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 TUBB8Q3ZCM7 444 aa20.05■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 COLEC12Q5KU26 742 aa20.05■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 DUPD1Q68J44 220 aa20.05■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa20.05■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 STRA8Q7Z7C7 330 aa20.05■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 TBC1D19Q8N5T2 526 aa20.05■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 CDKL2Q92772 493 aa20.05■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 ATG10Q9H0Y0 220 aa20.05■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 TXNDC16Q9P2K2 825 aa20.05■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 TRPC4Q9UBN4 977 aa20.05■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa20.05■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa20.04■□□□□ 0.8
LTB-211ENST00000446745 PCDH17O14917 1159 aa20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms