RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 CLIC1O00299 241 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC22A1O15245 554 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 NSG1P42857 185 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 KIR3DL1P43629 444 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 CLCA4Q14CN2 919 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 OXA1LQ15070 435 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 PTCHD3Q3KNS1 767 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR33Q49SQ1 333 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 KDM4DQ6B0I6 523 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 NEK5Q6P3R8 708 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 RFLNAQ6ZTI6 216 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 HORMAD1Q86X24 394 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 TESCQ96BS2 214 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 TM9SF3Q9HD45 589 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 CLEC4EQ9ULY5 219 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 FKBP9O95302 570 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ENGP17813 658 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ITPKAP23677 461 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 RXRGP48443 463 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 EPHB3P54753 998 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 NCS1P62166 190 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 RETSATQ6NUM9 610 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF621Q6ZSS3 439 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ADCK1Q86TW2 530 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 NELL1Q92832 810 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 CMTM7Q96FZ5 175 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 IL21Q9HBE4 155 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 IL23AQ9NPF7 189 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF17Q9P2E2 1029 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC22A14Q9Y267 594 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ALPK3Q96L96 1907 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 FPGTO14772 594 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 FGBP02675 491 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 FABP3P05413 133 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 C8AP07357 584 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 JUNDP17535 347 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 IRS1P35568 1242 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 B4GALNT1Q00973 533 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 IFITM3Q01628 133 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 KEAP1Q14145 624 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ATG16L2Q8NAA4 619 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 MYLIPQ8WY64 445 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ASIC4Q96FT7 647 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 VPS4AQ9UN37 437 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 PRAMEF4O60810 478 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM20BO75063 409 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 CTNNB1P35222 781 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 CCR2P41597 374 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 FPGSQ05932 587 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 INAQ16352 499 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 DGUOKQ16854 277 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 VMACQ2NL98 169 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 YIPF6Q96EC8 236 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 TCEAL4Q96EI5 215 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 VMP1Q96GC9 406 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 COPS8Q99627 209 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 APOL4Q9BPW4 351 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 MROQ9BYG7 248 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ZBP1Q9H171 429 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 CCL26Q9Y258 94 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 AMD1P17707 334 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ACVR2AP27037 513 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 MAPK1P28482 360 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 HOXA9P31269 272 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 TGFBR1P36897 503 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 HALP42357 657 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 NOXRED1Q6NXP6 359 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 CRTC1Q6UUV9 634 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 SERPINA11Q86U17 422 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 VRK3Q8IV63 474 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ATG10Q9H0Y0 220 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 NECTIN3Q9NQS3 549 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT84Q9NSB2 600 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 STOML2Q9UJZ1 356 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 OBSL1O75147 1896 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 RGS10O43665 173 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNK5O95279 499 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 HIST1H2ADP20671 130 aa18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms