RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 C2orf48Q96LS8 159 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 LGMNQ99538 433 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 FEVQ99581 238 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC2A11Q9BYW1 496 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDH20Q9HBT6 801 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 GPR83Q9NYM4 423 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 SELENOKQ9Y6D0 94 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGSF1Q8N6C5 1336 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A1W2PPM1 405 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 ADAM20O43506 726 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 SNX3O60493 162 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPS6KA5O75582 802 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 CEACAM4O75871 244 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 PGM3O95394 542 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 STARD3NLO95772 234 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 ITIH1P19827 911 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 AZU1P20160 251 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 CD22P20273 847 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 ALDH1B1P30837 517 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 CETN2P41208 172 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR3A2P47893 321 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 ASCL1P50553 236 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 CD300CQ08708 224 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 PTPRCAPQ14761 206 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 OPCMLQ14982 345 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 VWC2Q2TAL6 325 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 HIGD2BQ4VC39 106 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 GARNL3Q5VVW2 1013 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 CTR9Q6PD62 1173 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 LINC00612Q8N6U2 182 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 C17orf47Q8NEP4 570 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 CPNE1Q99829 537 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 GPR88Q9GZN0 384 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 Q9H8V8 135 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 TBC1D7Q9P0N9 293 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 TXNDC16Q9P2K2 825 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRDM4Q9UKN5 801 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF510Q9Y2H8 683 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 WIPI2Q9Y4P8 454 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRPV2Q9Y5S1 764 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 CASTOR2A6NHX0 329 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 ACOD1A6NK06 481 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 NPIPB9F8W1W9 429 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 AHCYL1O43865 530 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRT33AO76009 404 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCR3P51677 355 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 LIMK2P53671 638 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 IRX4P78413 519 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 FCHO2Q0JRZ9 810 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRKG2Q13237 762 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 WDR78Q5VTH9 848 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRT39Q6A163 491 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 IQCHQ86VS3 1027 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZFAND4Q86XD8 727 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 HPS6Q86YV9 775 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 FBXL16Q8N461 479 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 NPRL2Q8WTW4 380 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 PIK3R3Q92569 461 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 PROX1Q92786 737 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 TOMM40LQ969M1 308 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM218AQ96MZ4 157 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAP3K3Q99759 626 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 OVOL2Q9BRP0 275 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRR34Q9NV39 138 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANAPC2Q9UJX6 822 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 PTGESO14684 152 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 TADA2AO75478 443 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 CSN3P07498 182 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 CYP11B2P19099 503 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 AOC1P19801 751 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 AADACP22760 399 aa2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms