RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 AKIP1Q9NQ31 210 aa27.14■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 INSL5Q9Y5Q6 135 aa27.14■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 DPM1O60762 260 aa27.13■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 SRCP12931 536 aa27.13■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 CD70P32970 193 aa27.13■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 HALP42357 657 aa27.13■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 SEMG2Q02383 582 aa27.13■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 UGT8Q16880 541 aa27.13■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 NEK10Q6ZWH5 1172 aa27.13■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 SLCO6A1Q86UG4 719 aa27.13■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 P2RY13Q9BPV8 354 aa27.13■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 CLEC4EQ9ULY5 219 aa27.13■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 PRAMEF4O60810 478 aa27.13■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 LHCGRP22888 699 aa27.13■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 CHIT1Q13231 466 aa27.13■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 VEZF1Q14119 521 aa27.13■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa27.13■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 NAT16Q8N8M0 369 aa27.13■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 ABCG8Q9H221 673 aa27.13■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 SCN2BO60939 215 aa27.12■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 CYP4B1P13584 511 aa27.12■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 CD6P30203 668 aa27.12■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 SERPINB10P48595 397 aa27.12■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 ITGA1P56199 1179 aa27.12■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 WNT3P56703 355 aa27.12■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 IL1RL1Q01638 556 aa27.12■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 KCNC3Q14003 757 aa27.12■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa27.12■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 P2RY8Q86VZ1 359 aa27.12■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 PTOV1Q86YD1 416 aa27.12■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 VRK3Q8IV63 474 aa27.12■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 SLC22A15Q8IZD6 547 aa27.12■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa27.12■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 hCG_2039718K7EN88 272 aa27.12■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 M0R3G1 203 aa27.12■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 VLDLRP98155 873 aa27.12■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 DGUOKQ16854 277 aa27.12■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 LDLRAP1Q5SW96 308 aa27.12■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa27.12■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 ZNF621Q6ZSS3 439 aa27.12■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 EBPLQ9BY08 206 aa27.12■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 KIF17Q9P2E2 1029 aa27.12■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa27.12■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 RGS10O43665 173 aa27.11■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 COX7A2P14406 83 aa27.11■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 ITPKAP23677 461 aa27.11■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 SPINT3P49223 89 aa27.11■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 ST13P50502 369 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 LAPTM4AQ15012 233 aa27.11■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 BBS7Q8IWZ6 715 aa27.11■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 HSH2DQ96JZ2 352 aa27.11■■□□□ 1.93
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UBP1-201ENST00000283628 KRT84Q9NSB2 600 aa27.11■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 VPS29Q9UBQ0 182 aa27.11■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 HS3ST2Q9Y278 367 aa27.11■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 C1SP09871 688 aa27.1■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 CDH3P22223 829 aa27.1■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 HOXA9P31269 272 aa27.1■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 PFN3P60673 137 aa27.1■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 CLCA4Q14CN2 919 aa27.1■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 C22orf39Q6P5X5 142 aa27.1■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 PITX2Q99697 317 aa27.1■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 SELENONQ9NZV5 590 aa27.1■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 GRK3P35626 688 aa27.1■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 IRF8Q02556 426 aa27.1■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 TRIM16LQ309B1 348 aa27.1■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 ADPRMQ3LIE5 342 aa27.1■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 FAHD1Q6P587 224 aa27.1■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 RFLNAQ6ZTI6 216 aa27.1■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 ZNF540Q8NDQ6 660 aa27.1■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa27.1■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 MROQ9BYG7 248 aa27.1■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 FBXO8Q9NRD0 319 aa27.1■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 CFAP97Q9P2B7 532 aa27.1■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa27.1■■□□□ 1.93
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UBP1-201ENST00000283628 FKBP9O95302 570 aa27.09■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 MAP2K4P45985 399 aa27.09■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 PROX2Q3B8N5 592 aa27.09■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 PRSS48Q7RTY5 328 aa27.09■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 VTCN1Q7Z7D3 282 aa27.09■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 RASGRP3Q8IV61 690 aa27.09■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 SYNPOQ8N3V7 929 aa27.09■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 MINDY2Q8NBR6 621 aa27.09■■□□□ 1.93
UBP1-201ENST00000283628 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa27.09■■□□□ 1.93
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