RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 ICE2Q659A1 982 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 SPESP1Q6UW49 350 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 FRMD7Q6ZUT3 714 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 SNX31Q8N9S9 440 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 AGBL5Q8NDL9 886 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 CNDP1Q96KN2 507 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 OR2A14Q96R47 310 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 ACAT2Q9BWD1 397 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 GPRC5BQ9NZH0 403 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 KCNE2Q9Y6J6 123 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 SERPINB5P36952 375 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 ARL4DP49703 201 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 FOXR1Q6PIV2 292 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 RAB11FIP2Q7L804 512 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 DRC3Q9H069 523 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 IPPKQ9H8X2 491 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 C1GALT1Q9NS00 363 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 SH2B3Q9UQQ2 575 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 DYRK1BQ9Y463 629 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 LOXL2Q9Y4K0 774 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM114B3SHH9 223 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 OR7A17O14581 309 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 EDF1O60869 148 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 KATNA1O75449 491 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 ABATP80404 500 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 PCDH1Q08174 1060 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 RCN2Q14257 317 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 SF1Q15637 639 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 SLC5A12Q1EHB4 618 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 FAM47EQ6ZV65 393 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 TRIM73Q86UV7 250 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 CARFQ8N187 725 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 OR2L3Q8NG85 312 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 TRPC4APQ8TEL6 797 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 SLC5A11Q8WWX8 675 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 NEIL2Q969S2 332 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 PPM1MQ96MI6 270 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 TRMOQ9BU70 441 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 SATB2Q9UPW6 733 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 MSRB2Q9Y3D2 182 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 A0A0J9YY10 115 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 CCNDBP1O95273 360 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 FKBP9O95302 570 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 JMJD7P0C870 316 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 TSPAN8P19075 237 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 GNAZP19086 355 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 ARRB2P32121 409 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 CCR10P46092 362 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 YBX1P67809 324 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 BST1Q10588 318 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 LCP2Q13094 533 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 STX3Q13277 289 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 C17orf64Q86WR6 236 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 FAM129CQ86XR2 697 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 KMT5CQ86Y97 462 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 LSMEM2Q8N112 164 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 SOHLH2Q9NX45 425 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
HOXD11-201ENST00000249504 E7EQ34 232 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD11-201ENST00000249504 PPP6CO00743 305 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD11-201ENST00000249504 PLD2O14939 933 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD11-201ENST00000249504 CLGNO14967 610 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD11-201ENST00000249504 PRAMEF4O60810 478 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD11-201ENST00000249504 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
HOXD11-201ENST00000249504 MLYCDO95822 493 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD11-201ENST00000249504 CMPK1P30085 196 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD11-201ENST00000249504 GABREP78334 506 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD11-201ENST00000249504 SHC2P98077 582 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD11-201ENST00000249504 TRAF3Q13114 568 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD11-201ENST00000249504 E2F2Q14209 437 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD11-201ENST00000249504 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD11-201ENST00000249504 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD11-201ENST00000249504 ATG14Q6ZNE5 492 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD11-201ENST00000249504 PIGWQ7Z7B1 504 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD11-201ENST00000249504 FAM20CQ8IXL6 584 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD11-201ENST00000249504 OR52B6Q8NGF0 335 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD11-201ENST00000249504 KLHL6Q8WZ60 621 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF382Q96SR6 550 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD11-201ENST00000249504 NTMT1Q9BV86 223 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD11-201ENST00000249504 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
HOXD11-201ENST00000249504 THAP1Q9NVV9 213 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD11-201ENST00000249504 SEMA5BQ9P283 1151 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD11-201ENST00000249504 STK38LQ9Y2H1 464 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD11-201ENST00000249504 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXD11-201ENST00000249504 EFCAB7A8K855 629 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXD11-201ENST00000249504 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
HOXD11-201ENST00000249504 MAP3K7O43318 606 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXD11-201ENST00000249504 ITM2AO43736 263 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXD11-201ENST00000249504 SNNO75324 88 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
HOXD11-201ENST00000249504 HGFP14210 728 aa18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms