RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219302.7

NME3-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME3, Length 1,069 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-201ENST00000219302 FMO4P31512 558 aa14.95□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 NPY2RP49146 381 aa14.95□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 ARHGAP19Q14CB8 494 aa14.95□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 TYSND1Q2T9J0 566 aa14.95□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 TMEM207Q6UWW9 146 aa14.95□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 MFSD3Q96ES6 412 aa14.95□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 CCDC120Q96HB5 630 aa14.95□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 PHF12Q96QT6 1004 aa14.95□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 KIFC1Q9BW19 673 aa14.95□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 YIPF2Q9BWQ6 316 aa14.95□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 IL22Q9GZX6 179 aa14.95□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 RUBCNLQ9H714 662 aa14.95□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 CSMD2Q7Z408 3487 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 I3L1I5 382 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 CCL21O00585 134 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 VPS26AO75436 327 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 UNC5CO95185 931 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 VAPBO95292 243 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 RASAL1O95294 804 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 CRYABP02511 175 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 ICAM2P13598 275 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 CA7P43166 264 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 ADARP55265 1226 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 SYT16Q17RD7 645 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 ACSBG2Q5FVE4 666 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 MRGPRGQ86SM5 289 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 TCF12Q99081 682 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 PKP4Q99569 1192 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 STMN3Q9NZ72 180 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 BFARQ9NZS9 450 aa14.94□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 OR5H15A6NDH6 313 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 H3BMM5 538 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 PRAMEF2O60811 474 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 ESR1P03372 595 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 PKMP14618 531 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 FAM53BQ14153 422 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 KLHL38Q2WGJ6 581 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 SEL1L2Q5TEA6 688 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 ICE2Q659A1 982 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 MRNIPQ6NTE8 343 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 CES3Q6UWW8 571 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 SHISA5Q8N114 240 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 CCDC89Q8N998 374 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 FAM136AQ96C01 138 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 DESI2Q9BSY9 194 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 TUBB6Q9BUF5 446 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 DRC3Q9H069 523 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 SEC14L3Q9UDX4 400 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 TAC3Q9UHF0 121 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 MKL2Q9ULH7 1088 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 F8P00451 2351 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 DCHS2Q6V1P9 2916 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 SCN2AQ99250 2005 aa14.93□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 GOLGA8KD6RF30 607 aa14.92□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 E7ENX8 843 aa14.92□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 GOLGA8TH3BQL2 631 aa14.92□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 AP3B1O00203 1094 aa14.92□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 TXNDC9O14530 226 aa14.92□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 P2RX6O15547 441 aa14.92□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 SLC16A8O95907 504 aa14.92□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 ANXA5P08758 320 aa14.92□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 CHRM3P20309 590 aa14.92□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 MGAT1P26572 445 aa14.92□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 HTR1EP28566 365 aa14.92□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 PTGER4P35408 488 aa14.92□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 HSD17B2P37059 387 aa14.92□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 PNLIPRP1P54315 467 aa14.92□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 AP2B1P63010 937 aa14.92□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 TAP2Q03519 686 aa14.92□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 KCNJ11Q14654 390 aa14.92□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 CCNG2Q16589 344 aa14.92□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 ABHD17BQ5VST6 288 aa14.92□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 H3F3CQ6NXT2 135 aa14.92□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms