RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000046207.8

Sf3b6-201, Transcript of Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sf3b6, Length 1,180 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Six1Q62231 284 aa14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 BegainQ68EF6 600 aa14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Jade3Q6IE82 823 aa14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Shc4Q6S5L9 626 aa14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Tmem121Q80XA0 318 aa14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Ccdc181Q80ZU5 509 aa14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Olfml1Q8BSH2 233 aa14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Scara3Q8C850 606 aa14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Zfp449Q8CB76 518 aa14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 C1saQ8CG14 688 aa14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Trim31Q8R0K2 507 aa14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 NlnQ91YP2 704 aa14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Spred1Q924S8 444 aa14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Sike1Q9CPR7 207 aa14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Desi2Q9D291 194 aa14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Olfr630Q9EQQ7 319 aa14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Kdelc1Q9JHP7 502 aa14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Copg2Q9QXK3 871 aa14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Atp6ap1Q9R1Q9 463 aa14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 VarsQ9Z1Q9 1263 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Sdk1Q3UH53 2193 aa14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 2410004P03RikA0A087WQY2 205 aa14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Apol8A2VDH7 339 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Gm14525B1AZA0 212 aa14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Gm2012B1B0R1 212 aa14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Tmem200cJ3QK46 637 aa14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Top3aO70157 1003 aa14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 GmnnO88513 206 aa14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Scg5P12961 212 aa14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Pms2P54279 859 aa14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Rpl22P67984 128 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Foxred1Q3TQB2 487 aa14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Dtx3lQ3UIR3 748 aa14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Gpd1lQ3ULJ0 351 aa14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Xrcc1Q60596 631 aa14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Rbbp7Q60973 425 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Lamb3Q61087 1168 aa14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Gm14819Q62478 212 aa14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Klhdc10Q6PAR0 439 aa14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Lrit2Q6PFC5 549 aa14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Vmn2r81Q80Z09 865 aa14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Snx32Q80ZJ7 404 aa14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 NfascQ810U3 1240 aa14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 B3gnt5Q8BGY6 376 aa14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Scnm1Q8K136 229 aa14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Gfm2Q8R2Q4 779 aa14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Klrb1fQ8VD98 217 aa14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Olfr606Q8VGZ8 319 aa14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Kcne2Q9D808 123 aa14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Ccr10Q9JL21 362 aa14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Acss2Q9QXG4 701 aa14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 LrbaQ9ESE1 2856 aa14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Gm6370A0A0G2JGX9 315 aa14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Mrgpra2aA0A0R4J1Z0 331 aa14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Gm17949A0A1B0GRV7 212 aa14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Gm6309L7N481 315 aa14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Psmb5O55234 264 aa14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 CatP24270 527 aa14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Il1rnP25085 178 aa14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Apex1P28352 317 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Drg1P32233 367 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 AcadlP51174 430 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 St3gal1P54751 337 aa14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Sult1d1Q3UZZ6 295 aa14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Vsx2Q61412 361 aa14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 MelkQ61846 643 aa14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Jak3Q62137 1100 aa14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Oscp1Q8BHW2 379 aa14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 ExogQ8C163 368 aa14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Otud7aQ8R554 926 aa14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Olfr441Q8VFS5 310 aa14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Crtc3Q91X84 619 aa14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 TfQ921I1 697 aa14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Prl8a9Q9CQ58 241 aa14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Atp13a2Q9CTG6 1169 aa14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Slc10a6Q9CXB2 373 aa14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Sohlh2Q9D489 467 aa14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Ccdc97Q9DBT3 340 aa14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Usp9xP70398 2559 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Fam71f2B2RXB0 297 aa14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Tmem92B7ZWI3 162 aa14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Morc3F7BJB9 942 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Nrp2O35375 931 aa14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 JunP05627 334 aa14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 CfpP11680 464 aa14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Tpm3P21107 285 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Il5raP21183 415 aa14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 PenkP22005 268 aa14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Grb7Q03160 535 aa14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Shisa6Q3UH99 525 aa14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Tapt1Q4VBD2 564 aa14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Grb10Q60760 621 aa14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Fkbp10Q61576 581 aa14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Zc3h11aQ6NZF1 792 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 PrlhrQ6VMN6 370 aa14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Chst14Q80V53 376 aa14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Fam92aQ8BP22 355 aa14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 BC024139Q8BVJ3 772 aa14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Banf2Q8BVR0 90 aa14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Arhgap29Q8CGF1 1266 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.6 ms