RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586268.5

NEDD4L-215, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-215	ENST00000586268	TAC3	Q9UHF0	121 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-215	ENST00000586268	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-215	ENST00000586268	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-215	ENST00000586268	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-215	ENST00000586268	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-215	ENST00000586268	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-215	ENST00000586268	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-215	ENST00000586268	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-215	ENST00000586268	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	CCNDBP1	O95273	360 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	PDYN	P01213	254 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	VIP	P01282	170 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	HSD3B1	P14060	373 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	PRPH2	P23942	346 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	HSD3B2	P26439	372 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	CTSK	P43235	329 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	ERVK-8	P63133	956 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	ABAT	P80404	500 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	KLF10	Q13118	480 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	NR6A1	Q15406	480 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	GSTA3	Q16772	222 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	MED27	Q6P2C8	311 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	TREML1	Q86YW5	311 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	LMX1A	Q8TE12	382 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	LCN9	Q8WX39	176 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	UBE2E3	Q969T4	207 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	NSL1	Q96IY1	281 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	NRTN	Q99748	197 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	PCM1	Q15154	2024 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268		A0A1B0GVT2	93 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	PIPSL	A2A3N6	862 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	LMO7DN	F2Z398	122 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	AQP9	O43315	295 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	GPR37L1	O60883	481 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	PIAS2	O75928	621 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	UNC5C	O95185	931 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	T-ENOL	P0DO92	83 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	CDH1	P12830	882 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	CXCR2	P25025	360 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	HOXD12	P35452	270 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	DPP6	P42658	865 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	STX1B	P61266	288 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	REEP5	Q00765	189 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	HERC3	Q15034	1050 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	IMPG1	Q17R60	797 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	ICE2	Q659A1	982 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	FAM129C	Q86XR2	697 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	LAS2	Q8IYD9	372 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	KRT78	Q8N1N4	520 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	PATE1	Q8WXA2	126 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	ACPT	Q9BZG2	426 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	NT5DC2	Q9H857	520 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	BRF2	Q9HAW0	419 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268		B4DGG1	531 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-215	ENST00000586268	YY2	O15391	372 aa		13.43	□□□□□ -0.26

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