RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568561.5

NME3-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NME3, Length 813 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-211ENST00000568561 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
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NME3-211ENST00000568561 USP1O94782 785 aa14.77□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 F7P08709 466 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 STSP08842 583 aa14.77□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.05
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NME3-211ENST00000568561 FMO4P31512 558 aa14.77□□□□□ -0.05
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NME3-211ENST00000568561 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
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NME3-211ENST00000568561 CSNK1A1LQ8N752 337 aa14.76□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 AMER3Q8N944 861 aa14.76□□□□□ -0.05
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NME3-211ENST00000568561 LPGAT1Q92604 370 aa14.76□□□□□ -0.05
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NME3-211ENST00000568561 TRAV17A0A0B4J275 112 aa14.75□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 PCDH17O14917 1159 aa14.75□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 KPNA5O15131 536 aa14.75□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 P2RX6O15547 441 aa14.75□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 SERPINA7P05543 415 aa14.75□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 ITGAMP11215 1152 aa14.75□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 CXCR2P25025 360 aa14.75□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 TERF1P54274 439 aa14.75□□□□□ -0.05
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NME3-211ENST00000568561 ACSBG2Q5FVE4 666 aa14.75□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 GFRALQ6UXV0 394 aa14.75□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 PAQR7Q86WK9 346 aa14.75□□□□□ -0.05
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NME3-211ENST00000568561 SHISA5Q8N114 240 aa14.75□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 MPP5Q8N3R9 675 aa14.75□□□□□ -0.05
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NME3-211ENST00000568561 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
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NME3-211ENST00000568561 COPG2Q9UBF2 871 aa14.75□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 TAC3Q9UHF0 121 aa14.75□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa14.75□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 CRYL1Q9Y2S2 319 aa14.75□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 MRFAP1Q9Y605 127 aa14.75□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 CSMD2Q7Z408 3487 aa14.75□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa14.74□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 A0A1B0GUH1 482 aa14.74□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 I3L1I5 382 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 VPS26AO75436 327 aa14.74□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 MATN4O95460 622 aa14.74□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 WDPCPO95876 746 aa14.74□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 HEXBP07686 556 aa14.74□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 ERGP11308 486 aa14.74□□□□□ -0.05
NME3-211ENST00000568561 MST1P26927 711 aa14.74□□□□□ -0.05
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