RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	C8G	P07360	202 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	NR1D1	P20393	614 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	MCM3	P25205	808 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	IMPA1	P29218	277 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	ELK3	P41970	407 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CD97	P48960	835 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	RGS4	P49798	205 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	ARL4C	P56559	192 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CHAF1B	Q13112	559 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	NKG7	Q16617	165 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	MUM1	Q2TAK8	710 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	DCAF10	Q5QP82	559 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	MVB12A	Q96EY5	273 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CCDC138	Q96M89	665 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	SPSB2	Q99619	263 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	PARVB	Q9HBI1	364 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	C5AR2	Q9P296	337 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	TAC3	Q9UHF0	121 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	COL12A1	Q99715	3063 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	10.96	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137		H0YGG7	62 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	AGPS	O00116	658 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	PEX12	O00623	359 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	NRP2	O60462	931 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	TSPAN12	O95859	305 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	ITGA8	P53708	1063 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CDKN2D	P55273	166 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	10.96	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	10.96	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	MYBPC3	Q14896	1274 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	SLC9A5	Q14940	896 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	10.96	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	10.96	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	ANKRD7	Q92527	254 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	C10orf90	Q96M02	699 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	GPR83	Q9NYM4	423 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	10.96	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	10.96	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	10.96	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	PDE10A	Q9Y233	779 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	VWA7	Q9Y334	891 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137		A0A1W2PQ72	361 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	DPM1	O60762	260 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	MED26	O95402	600 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	FDXR	P22570	491 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	CCND1	P24385	295 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	OTX2	P32243	289 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	AP1S2	P56377	157 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	IL2	P60568	153 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	DSG2	Q14126	1118 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	FAM53B	Q14153	422 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	CYS1	Q717R9	158 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	PALM2	Q8IXS6	379 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	BBOF1	Q8ND07	529 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	MIB2	Q96AX9	1013 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	THAP11	Q96EK4	314 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	PWWP2A	Q96N64	755 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	KRT12	Q99456	494 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	NDN	Q99608	321 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	ERP44	Q9BS26	406 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	NUDT9	Q9BW91	350 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	SGPP1	Q9BX95	441 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		10.95	□□□□□ -0.66

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